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Super-enhancer modules controlling plasticity and response to therapy in pancreatic cancer

Descripción del proyecto

Caracterización del cáncer de páncreas a nivel de células individuales

El adenocarcinoma ductal pancreático (ADP, o PDAC por sus siglas en inglés) sigue siendo un cáncer con mal pronóstico. Sin embargo, indicios recientes indican que la estratificación en subtipos diferentes proporciona una guía mejor para decidir el tratamiento. A pesar de la heterogeneidad de los pacientes y la falta de datos sólidos, se cree que ciertos factores de transcripción actúan como desencadenantes de estos subtipos y los cambios en su expresión podrían incluso facilitar el cambio de subtipo. El proyecto financiado con fondos europeos PDASwITch estudiará el papel del microentorno tumoral en este fenómeno. Mediante el uso de tecnologías de perfilado de células única con un rendimiento elevado, los científicos caracterizarán la interferencia dinámica entre las células cancerosas y cómo esta afecta a su fenotipo. El objetivo final es convertir clínicamente los tumores que no responden en tumores que responden y mejorar los resultados en los pacientes.

Objetivo

"Recently discovered subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) have potential to better guide the choice of therapy. However, this is challenged by the lack of robust data, patient heterogeneity, tumour cell plasticity, dynamic crosstalk with surrounding cells, and post-chemotherapy induced alterations. A few transcription factors may act as drivers of specific PDAC subtypes and changes in there expression through aberrant activation of super-enhancers may lead to ‘’subtype switching’’. However, the effect of the tumour-microenvironment on enhancer-driven gene expression programme to promote ‘’subtype switching’’ in pancreatic tumour cells remains largely unexplored. Hence, with this proposal I aim to provide in-depth characterization of this dynamic crosstalk combining reporter tracing through fluorescent labelling of subtype-specific transcriptional drivers of tumour cell states with powerful high throughput single-cell technologies, and super-enhancer single cell profiling which will translate to a clinical study of neoadjuvant chemotherapy with sequential tumour sample profiling. This work will ultimately provide a platform for the development of methods to precisely determine the ""phenotypic"" state of PDAC cells and aid in designing new agents to target these processes, with the ultimate goal of converting non-responder to responder tumours and improve patient outcome."

Coordinador

FUNDACION SECTOR PUBLICO ESTATAL CENTRO NACIONAL INVESTIGACIONES ONCOLOGICAS CARLOS III
Aportación neta de la UEn
€ 160 932,48
Dirección
C MELCHOR FERNANDEZ ALMAGRO 3
28029 Madrid
España

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Región
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total
€ 160 932,48