Description du projet
Imagerie 3D des habitats bactériens du sous-sol
Les bactéries qui résident sous la surface de la terre jouent un rôle déterminant dans les cycles biogéochimiques. Elles ont également été exploitées aux fins de la bioremédiation et de la gestion des ressources en eau. Le projet MicroMix, financé par l’UE, s’intéresse à l’étude de l’environnement naturel et de la dynamique communautaire des bactéries du sous-sol. Les chercheurs partent du principe que la distribution des nutriments dans ces habitats suit un schéma plutôt chaotique qu’homogène. Ils ont construit un nouveau système de bioréacteur pour la formation de l’image des paysages chimiques et des colonies bactériennes dans des milieux poreux en 3D, comme ceux rencontrés dans l’habitat naturel des bactéries du sous-sol. Les résultats mettront au jour des aspects importants de la croissance et de la colonisation bactériennes dans différentes conditions.
Objectif
Subsurface bacteria represent a fundamental, yet poorly known, component of the Earth’s biosphere. These communities are key in biogeochemical cycles and in a range of problems in Environmental and Geosciences, ranging from water resources management and bioremediation, to CO2 sequestration and geothermal energy. Until recently, the opacity of 3D porous media-the natural habitat of subsurface bacteria-had prevented in situ and in vivo imaging of bacterial dynamics in such environments. Recent experimental and theoretical breakthroughs at the host institution have led to the discovery that flows in natural porous media are chaotic in nature. Since chaotic mixing is known to yield and sustain strong chemical gradients at micro-scale, this discovery challenges the assumption of homogeneous nutrient distributions, broadly-used in current models of subsurface microbial processes. The goal of MicroMix is thus to explore the effect of chaotic mixing on bacterial growth and colonization in 3D porous media under positive stimuli (WP1: mixing-limited nutrient resources) and negative stimuli (WP2: antibiotic source, nutrient rerouting by bioclogging). To do so, we will develop a novel bioreactor system, primarily based upon coupling high-resolution Laser Induced Fluorescence and optical index matching, which will allow us to obtain the first joint imaging of chemical landscapes and bacterial colonies in 3D porous media. The project builds upon the combined expertise of the ER in the field of biomicrofluidics, of the supervisor in mixing dynamics, and of the secondment supervisor on biofilm dynamics in porous media. Through a detailed career development plan, a tailored training program and access to key experimental facilities and scientific networks, MicroMix will ensure an efficient re-integration of the ER and place him at the forefront of research on environmental fluid dynamics.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement hydrologie
- sciences naturelles sciences physiques mécanique classique mécanique des fluides dynamique des fluides
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement sciences de l'atmosphère météorologie biosphère
- sciences naturelles sciences physiques optique physique des lasers
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
35065 RENNES CEDEX
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.