The missing majority: understanding global ocean ecology by revealing the unknown biology of the most abundant marine microbial eukaryotes

Informations projet

GROWCEAN

N° de convention de subvention: 949745

DOI

10.3030/949745

Date de signature de la CE 26 Novembre 2020

Date de début 1 Septembre 2021

Date de fin 31 Août 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 500 000,00

Contribution de l’UE

€ 1 500 000,00

Coordonné par

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Spain

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Publications

Peer reviewed articles (13)

Transportome remodeling of a symbiotic microalga inside a planktonic host

Auteurs: C Juery, A Auladell, Z Füssy, F Chevalier, DP Yee, E Pelletier, E Corre, AE Allen, DJ Richter, J Decelle
Publié dans: ISME Journal - International Society for Microbial Ecology, Numéro 18, 2026, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2024.06.01.596945

A novel taxonomic database for eukaryotic mitochondrial cytochrome oxidase subunit I gene (eKOI), with a focus on protists diversity

Auteurs: Rubén González-Miguéns, Àlex Gàlvez-Morante, Margarita Skamnelou, Meritxell Antó, Elena Casacuberta, Daniel J Richter, Enrique Lara, Daniel Vaulot, Javier del Campo, Iñaki Ruiz-Trillo
Publié dans: Database, Numéro 2025, 2025, ISSN 1758-0463
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/database/baaf057

A database of genome-scale predicted proteins across the diversity of eukaryotic life

Auteurs: Richter DJ, Berney C, Strassert JFH, Poh Y-P, Herman EK, Muñoz-Gómez SA, Wideman JG, Burki F, de Vargas C
Publié dans: Peer Community Journal, Numéro 2, 2022, Page(s) e56, ISSN 2804-3871
Éditeur: Peer Community Journal
DOI: 10.24072/pcjournal.173

Diverse patterns of correspondence between protist metabarcodes and protist metagenome-assembled genomes

Auteurs: Daryna Zavadska, Nicolas Henry, Adrià Auladell, Cédric Berney, Daniel J. Richter
Publié dans: PLOS ONE, Numéro 19, 2024, Page(s) e0303697, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0303697

Genomic evidence for global ocean plankton biogeography shaped by large-scale current systems

Auteurs: Richter, Daniel J.; Watteaux, Romain; Vannier, Thomas; Leconte, Jade; Frémont, Paul; Reygondeau, Gabriel; Maillet, Nicolas; Henry, Nicolas; Benoit, Gaëtan; da Silva, Ophélie; Delmont, Tom O.; Fernández-Guerra, Antonio; Suweis, Samir; Narci, Romain; Berney, Cedric; Eveillard, Damien; Gavory, Frederick; Guidi, Lionel; Labadie, Karine; Mahieu, Eric; Poulain, Julie; Romac, Sarah; Roux, Simon; Dimi
Publié dans: eLife, Numéro 78129, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.78129

The evolution of gene functional repertoire in Amorphea: divergent strategies across Amoebozoa, Fungi, and Metazoa

Auteurs: Alex Gàlvez-Morante, Cédric Berney, Daniel J Richter
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 43, 2026, Page(s) msag071, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msag071

Dollo parsimony overestimates ancestral gene content reconstructions

Auteurs: Gàlvez-Morante A, Guéguen L, Natsidis P, Telford MJ, Richter DJ
Publié dans: Genome Biology and Evolution, Numéro 16, 2024, ISSN 1759-6653
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evae062

Description of a New Telonemia Genus and Species with Novel Observations Providing Insights Into its Hidden Diversity

Auteurs: Helena Mostazo-Zapata, Alex Gàlvez-Morante, Cédric Berney, Xènia Maya-Figuerola, Cristiana Sigona, David López-Escardó, Elisabet L. Sà, Dolors Vaqué, Daniel J. Richter
Publié dans: Journal of Eukaryotic Microbiology, Numéro 72, 2026, ISSN 1066-5234
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1101/2025.05.28.656552

Taxonomic composition, community structure and molecular novelty of microeukaryotes in a temperate oligomesotrophic lake as revealed by metabarcoding

Auteurs: Mitsi K, Richter DJ, Arroyo AS, López-Escardó D, Antó M, Guillén A, Ruiz-Trillo I
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 13, 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-30228-4

OligoN‐Design: A Simple and Versatile Tool to Design Specific Probes and Primers From Large Heterogeneous Datasets

Auteurs: Miguel M. Sandin, Marie Walde, Nicolas Henry, Irene Forn, Nathalie Simon, Cédric Berney, Ramon Massana, Daniel J. Richter
Publié dans: Molecular Ecology Resources, Numéro 26, 2026, ISSN 1755-098X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1755-0998.70140

Looks can be deceiving: discordances in phylogeny and morphology within loricate choanoflagellates

Auteurs: Alex Gàlvez-Morante, Florentine U. Rutaganira, Brian Palenik, Daniel J. Richter
Publié dans: Open Biology, Numéro 16, 2026, ISSN 2046-2441
Éditeur: Royal Society Publishing
DOI: 10.1098/rsob.250261

Characterization of <i>Allobodo yubaba</i> sp. nov. and <i>Novijibodo darinka</i> gen. et sp. nov., cultivable free‐living species of the phylogenetically enigmatic kinetoplastid taxon Allobodonidae

Auteurs: Julia A. Packer, Daryna Zavadska, Elizabeth J. Weston, Yana Eglit, Daniel J. Richter, Alastair G. B. Simpson
Publié dans: Journal of Eukaryotic Microbiology, Numéro 72, 2025, ISSN 1066-5234
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jeu.13072

The Morphology and Small Subunit <scp>rDNA</scp> Gene Phylogeny of the Novel Goniomonad Genus <i>Ebisugoniomonas</i> and Two Novel <i>Poseidogoniomonas</i> Species

Auteurs: Daryna Zavadska, Maria Sachs, Hartmut Arndt, Daniel J. Richter
Publié dans: Journal of Eukaryotic Microbiology, Numéro 73, 2026, Page(s) e70088, ISSN 1066-5234
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jeu.70088

Non-peer reviewed articles (1)

On the relationship between protist metabarcoding and protist metagenome-assembled genomes

Auteurs: Zavadska D, Henry N, Auladell A, Berney C, Richter DJ
Publié dans: bioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2023.10.09.561583