Objetivo
Conifer trees are major components of forest ecosystems throughout the EU, both in its Southern and Northern regions, and provide a major source of wood and cellulose products whose demand is continuously increasing. Despite their economic and ecological relevance there is very limited information on the organization of protein coding sequences within chromosomes, the structural basis of metaphase chromosomes, the type and function of non coding DNA sequences and more generally on the genetics and genome structure of this group of species. This project will address basic and applied aspects of Conifer biology in the area of genome analysis and mapping and will aim to get a better understanding of how the conifer genome is organized in order to allow its efficient manipulation either via marker assisted breeding or genetic transformation. This in consideration of the fact that biotechnological tools are more and more frequently applied to forest tree breeding and that the huge size of Conifer genomes (8 x human, 250 x Arabidopsis thaliana genomes) makes it necessary to have a deep knowledge of their structure in order to be able to successfully manipulate them.
Four work packages have been devised in this Proposal aimed to i) provide a more comprehensive and comparative understanding of the structure and organization of Conifer genomes in terms of type and distribution of repetitive sequences, distribution of coding sequences and relationships between genetic and linkage maps (Work Package l); ii) construct second-generation linkage maps based on PCR markers and on anchor loci provided by cDNAs to define syntenic relationships among species (Work Package 2); iii) verify the feasibility of exploiting synteny to identify the genomic regions and genes involved in the determination of important traits such as "growth capacity" in a single "model" Conifer species (Work Package 3); iv) provide an easy way to disseminate results to potential end-users both from academia and private companies through the creation of a Web site for Conifer genome research (Work package 4). By analysing the genomes of three species belonging to two different genera (Picea abies, Pinus sylvestris, Pinus pinaster) we will gain a comparative view of genome organization. The comparative mapping approach will also verify the possibility of concentrating efforts in this area on a single species selected as a "model" and then being able to transfer the obtained results to any of the other Conifer species that are of economic and/or ecological importance in the EU. A deeper knowledge of genome and gene structure in Conifers will also provide an opportunity to determine how closely related gymnosperms are at the molecular level to angiosperms and to establish how relevant programmes on gene discovery and mapping in model angiosperm species such as rice and Arabidopsis are to Conifers. Knowledge of genome structure will also aid rational strategies for searches of useful genes in this group of species as well as lead to an improvement in molecular marker technology. This will in turn increase the ability to map genes of major economic importance. The proposed project, by bringing together a highly qualified group of laboratories with complementary expertises, will therefore attempt to provide a competitive advantage to the EC industries that are active in the area and to compete with the major research efforts in the area of Conifer tree mapping and gene discovery that are underway both in North America and Pacific-Rim countries.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas ecología ecosistemas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
33100 UDINE
Italia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.