Objectif
The principal objective of this proposal is to carry out a comprehensive program in structural biology to understand the mechanism of proton pumping by membrane bound proton pumps. The first work package aims at a determination of the three-dimensional atomic structure of bacteriorhodopsin(bR), one of natures light driven proton pumps, recorded at different time points in the photo cycle. The intermediate states in the photo cycle will be recorded using single crystals of bR combined with millisecond to picosecond diffraction techniques. The combination of high quality crystals, two photon reaction initiation and short x-ray pulses should make it possible to record the structure of the K. L and M intermediates at high resolution which is expected to pinpoint the proton translocation pathway. Complimentary experiments will exploit the temperature dependence of the photo cycle and isolate the intermediates by freeze trapping. Moreover crystals of bR mutants with longer lived intermediates will also be studied.
In the second work package we will examine chemically driven proton pumps by looking at oxygen reduction in the haem-containing respiratory oxidases quinol oxidase, cytochrome oxidase, and cytochrome cdl. These enzymes diffract to high resolution and are active in the crystal. Fast diffraction methods combined with spectroscopic techniques will be used to correlate electronic transitions with structural transitions. These techniques will be used to produce a three-dimensional movie of oxygen reduction by respiratory oxidases. The experiments are expected to reveal the oxygen chemistry in cytochrome c oxidase, which will aid our understanding of proton pumping in such enzymes. The studies will allow us to see how redox energy can be switched into conformational energy within a haem protein, a phenomenon of general importance.
The third work package deals with the optimization of stroposcopic diffraction techniques at the European Synchrotron Radiation Facility. It is foreseen to prepare the ID09 beamline for micro crystal diffraction, upgrade the x-ray source with a mini-gap undulator with 170 poles, install a high-flux Bragg-Bragg monochromator and to mount a femto-second microphotospectrometer on the sample goniostat. These developments will enable us to run stroposcopic diffraction experiments on the 50 picosecond, nanosecond, microsecond and milli-sec timescale and have on-line diagnostics of the excitation characteristics of the sample.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
38043 GRENOBLE
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.