Objectif
Research objectives and content
Indian peanut clump virus (IPCV) infects groundnut plants (Arachis hypogea L.), causing serious losses to peanut crops in the Indian sub-continent. IPCV is related to peanut clump virus which causes similar disease in African crops, both are i transmitted by Polymyxa sp..
The mechanism by which the virus is acquired by the fungus and is transmitted to host plants is unknown. Recently, a laboratory based system for studying IPCV transmission by Polymyxa zoospores was established at UCL, Louvain. Understanding the virus component of the transmission would be much enhanced by being able to make known mutations in the virus genome. The objective of the research is to obtain cloned cDNA in such a form that infective IPCV can be recovered from it. The work will involve (1) purification of virus RNA from an isolate recently transmitted by fungi, (2) PCR amplification and construction of a full-length cDNA clone for each genomic RNA, (3) preparation of mutants in open reading frames (ORF) possibly involved in transmission, (4) expression of mutant clones in plants by inoculation of transcript RNA or agro-inoculation of cDNA in a Ti plasmid. Virus clones will be sent to UCL for analysis in the Polymyxa transmission system
Training content (objective, benefit and expected impact)
Develop the expertise of the applicant in molecular virological techniques (molecular plant virologist are few in Europe), including c-DNA cloning, sequencing, mutagenesis and agro-inoculation. The work will be performed with already existing research programs at SCRI, UCL, and ICRISAT (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics), and will take the opportunity of recent research achievements for a better understanding of virus transmission by fungus, using IPCV-Polymyxa model. The model developped should be applied to other furoviruses causing economically significant diseases
Links with industry / industrial relevance (22)
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
DD2 5DA Dundee
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.