Objectif
Research objectives and content
Recent studies have demonstrated that cellulose binding domains (CBDs) play an important role in the activity of plant cell wall hydrolase against insoluble substrates. Pseudomonas enzymes consist of two distinct CBDs; a type II CBD domain and a second smaller domain. Although recent studies have shown that removal of both CBDs decreases the activity of Pseudomonas xylanase A (XYLA) against cellulose/hemicellulose complexes, it is unclear why Pseudomonas enzymes contain two distinct CBDs. The objective of this proposal is to determine the properties of the 40 residue CBD of XYLA and its role in the action of XYLA against the plant cell wall. Specifically, site-directed mutagenesis will be used to change the conserved aromatic residues to alanine to establish whether they play a pivotal role in binding cellulose, or are integral to the correct folding of the CBD. To establish the importance of the CBD in the activity of XYLA, xynA will be engineered such that it encodes two derivatives of XYLA in which either the large type II CBD (XYLA') or the small CBD (XYLA") has been removed. Analysis of the capacity of XYLA, XYLA' and XYLA" to hydrolyse cellulose/xylan complexes will establish why Pseudomonas glycosyl hydrolase, in general, have two distinct CBDs.
Training content (objective, benefit and expected impact)
This project will provide me with an excellent training in the use of recombinant DNA technology (site-directed mutagenesis, PCR, DNA sequencinge etc) to study the structure and function of proteins. I already have experience in the use of both biochemical and chemical techniques to study industrially important enzymes. At the completion of my training I will be able to use recombinant DNA technology to produce large quantities of these proteins, and engineer their structure to underpin more sophisticated studies on these important biocatalysts.
Links with industry / industrial relevance (22)
Professor Gilbert has strong industrial contacts with Zeneca BioProducts (enzymes in the Paper Pulp Industry), Thomas Swan (Paper pulp Industry), Genacor (Detergent Industry), Dalgety and FinnFeeds International (Animal Feeds and the Food industry).
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse biocatalyse
- ingénierie et technologie biotechnologie industrielle biomatériaux
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
NE1 7RU Newcastle - Upon Tyne
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.