Objectif
Research objectives and content
The aim of the project is the characterization of the factors involved in intron recognition and assembly of the spliceosome, a basic process of pre-mRNA processing. We want to understand the mechanisms by which the cell recognizes an intron and decides to cut it out. We want to assess the role of the different factors present in U1 snRNP, the first particle that binds the pre-mRNA. We will study the recently described U1 snRNP proteins by using biochemistry and molecular biology methods. We will use yeast as a model. The availability of its genome and the fact that it is widely used in research makes it suitable for our purposes. This project has been started funded with an EC institutional fellowship that covers only one year. From our preliminary results we have found a protein that is part of the U1 snRNP and seems to have an important function in pre-mRNA recognition. We have also started to study other 4 proteins present in U1 snRNP in order to address their role in this particle. I have already purified the U1 snRNP and we want to carry out biochemical reconstitution of this particle to get commitment complexes. This knowledge will allow us to understand how the splicing machinery is able to distinguish between fully spliced RNAs and intron-containing pre-mRNAs, a basic process in pre-mRNA maturation.
Training content (objective, benefit and expected impact)
During my Ph. D. Thesis I have acquired training in molecular biology techniques. This project will be a perfect complement in my formation since I will use molecular biology, biochemistry and yeast genetics methodology to address the questions mentioned above. The EMBL provides a good environment for research. It has any facility required to perform the research project. This together with its scientific atmosphere will contribute to my education in such a way that allows me to carry out independent research. The analysis of spliceosome assembly will allow us ultimately to understand how splicing catalysis and accurate splice site selection are achieved. This knowledge will give us clues about how alternative splicing is carried out in the cells. This knowledge has direct implications to understand the regulation of gene expression. Links with industry / industrial relevance (22)
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
69012 Heidelberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.