Objetivo
Research objectives and content
Regulation of bacterial responses to stress often involves control of activity and stability of sigma factors. This project aims to dissect such regulatory mechanisms using E. coli sigma32 and sigmaS. Sigma32 controls heat shock genes encoding chaperones and proteases. Heat shock increases stability and activity sigma32 thereby increasing expression of heat shock genes. The DnaK and DnaJ chaperones mediate this regulation by stress-dependent association with sigma32 thereby repressing its activity and controlling its degradation by the protease FtsH. SigmaS controls general stress genes which protect cells from starvation damage. Starvation prevents sigmaS degradation by the ClpXP protease in a DnaK-dependent process. For both sigma factors genetic evidence suggests that control of their stability and activity requires short segments within the sigma32 and sigmaS polypeptides that are in similar relative position. Using genetic and biochemical tools it will be investigated whether these segments represent regulatory modules. It will then be attempted to identify residues which are essential for protease and ligand (DnaK, DnaJ) recognition. Identification of the recognition principles are relevant to the understanding of other stress regulations involving similar control mechanisms of sigma factors (e.g. SigB in B. subtilis) and eucaryotic transcription factors (e. g. . heat shock transcription factor).
Training content (objective, benefit and expected impact)
The planned project is expected to identify molecular principles governing the regulation of two important stress responses in E. coli. The results may serve as a paradigm for understanding other stress responses in bacteria and the heat shock response in eucaryotes. It may also allow to manipulate the content of chaperones in bacteria which is of interest to biotechnology since it may allow to increase the yield of soluble recombinant protein. This project could give me the opportunity to acquire novel experimental techniques (e. g. protein purification, analysis of protein interactions, crosslinking, in vitro transcription assays) which are essential for my future scientific career.
Links with industry / industrial relevance (22)
Collaborations of the host laboratory with Boehringer (Mannheim) and Hoffmann-La Roche (Basel) exist, aiming at using chaperones to avoid aggregation of recombinant proteins.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Le pedimos disculpas, pero se ha producido un error inesperado durante la ejecución.
Necesita estar autentificado. Puede que su sesión haya finalizado.
Gracias por su comentario. En breve recibirá un correo electrónico para confirmar el envío. Si ha seleccionado que se le notifique sobre el estado del informe, también se le contactará cuando el estado del informe cambie.
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
79104 FREIBURG (IN BREISGAU)
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.