Objetivo
Research objectives and content
The aim of this study is a better unterstanding of the biosynthesis of polyketides, especially of formation the lacton ring. Therefore we will overproduce several essential polyketide synthase domains, mainly a acetyl transferase, a Beta-ketoacyl synthase, an acyl transferase and an acyl carrier protein, in E. coli and / or Saccharopolyspora erythrea. The recombinant proteins will be purified and examined for their catalytic activities. Therefore we will investigate the modification of ACP with the cofactor 4'-phosphopantetheine. This will allow the development of new enzymatic assays for exploring the catalytic activties of the Beta-ketoacyl synthase domain. Furthermore, this could be a first step towards a complete in vitro biosynthesis of macrolactone rings. Another aspect will be the crystallization of the domains in order to obtain precious insights into the three-dimensional structure. These findings will allow to determine, which aa-residues are important for catalytic activity or interactions with other domains. Subsequently, it would be possible to point out the functions of these aa-residues by mutational analysis.
Training content (objective, benefit and expected impact)
After investigating the non-ribosomal biosynthesis of peptide-antibiotics, it will be very interesting for me to extend this knowledge to a new challenging field of antibiotic-research. Producing polyketide synthase domains domains and investigating the catalytic activities of these recombinant proteins will offer me a good opportunity to gain experience with Actinomycetes such as Streptomyces and Saccharopolyspora and the enzymology of polyketide biosynthesis.
Links with industry / industrial relevance
As far as this study is concerned, there will be no direct collaborations with industry. Because many companies are likewise investigating polyketide biosynthesis in order to obtain new efficient antibiotics or to increase the rate of the in vivo biosynthesis, it can be assumed, that this study will be interesting for the industry.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias médicas y de la salud medicina básica farmacología y farmacia medicamento antibióticos
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
CB2 1GA CAMBRIDGE
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.