Objectif
Research objectives and content
The cysteine proteinase superfamily which includes enzymes of biological and medical importance is a source of natural structural variants of value in the investigation of mechanism. Recent work in the QMW Laboratory has produced definitive evidence that the ion-pair state
(Cys25)_S-/(HislS9)-/Im+ (C-H+) is formed across pKa valueS 2.5-3.3 and is fully developed at low pH where the enzymes are inactive. Catalytic competence requires an additional protonic dissociation at higher pH values with a pKa value close to 4. Experiments on Asp158Asn mutants have ruled out Asp158, the nearest carboxylate to the ion-pair, as the electrostatic switch. Electrostatics potential calculations suggest that two electrostatic clusters, centred on Glu50 and Glu 135 respectively, are prime candidates to contribute the carboxylate switch. The research objective is to generate a range of mutants of papain and caricain and to characterize the active centre chemistry and catalytic characteristics by stopped-flow kinetics using specially designed and synthesized time-dependent inhibitors as reactivity probes. Crystal structures of the key mutants will be determined in collaboration with IFR, Reading, UK. The ionization characteristics of the catalytic site histidine sidechains will be determined by NMR spectroscopy. The project will produce a detailed description of cysteine proteinase mechanism and will contribute substantially to our understanding of the roles of electrostatic effects and key binding interactions in catalytic site chemistry.
Training content (objective, benefit and expected impact)
Studies on the natural cysteine proteinase variants and the key mutants will properly define for the first time the catalytic mechanism of this class of enzymes. Training will be provided in the study of catalytic mechanism by rapid kinetics, protein engineering and computational techniques. The acquisition of these techniques will complement my existing experience and expertise in the fields of organic synthesis, immunology and protein chemistry.
Links with industry / industrial relevance (22)
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux cristaux
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie spectrométrie d’absorption
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
E1 4NS London
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.