Objectif
Research objectives and content
Theoretical models show that transposable element (TE's) insertions at individual genomic sites are expected at lowfrequency as a result of an equilibrium between transpositional increase in element abundance and one or more opposing forces. High frequencies or fixation are expected only if element insertions have functional significance to their hosts. In Drosophila, the technique of in situ hybridization on the polytene chromosomes permits identification of sites occupied by TE's in chromosomes isolated from natural populations. The data on D. melanogaster unequivocally shows that the frequency of occupation of a given chromosomal site by a member of a particular family is nearly always very low. There is only a handful of exceptions, which form the subject of this proposal.
l Objectives:
1- To determine whether (1) these apparently fixed insertions involve individual nucleotide sites or (2) reflect insertions at different locations within the same band. In situ hybridization permits the localisation of the insertions in terms of chromosome bands, being necessary a molecular approach in order to discriminate between this two alternative hypothesis.
2- If (1) is the case, to determine the causes of high element frequencies or fixation at an unique site. Molecular characterization of the insertion site will shed a light on the evolutionary forces that drove this insertions to high frequency or fixation .
Training content (objective, benefit and expected impact)
Objective: to improve my training in the following subjects: Molecular biology techniques: DNA handling, in situ and dot-blot hybridization, southern blotting, DNA cloning, PCR, DNA sequencing.
Other methods: DNA sequence analysis.
Theoretical population genetics training: The study of the nature of the forces that regulate TE abundance in thehost genome is crucial to understanding the organization and evolution of the genome, and therefore a most interesting task in evolutionary biology.
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Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biologie de l'évolution
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
EH9 3JT EDINBURGH
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.