Objectif
Research objectives and content When cells are exposed to tumor necrosis factor (TNF) two antagonistic pathways are induced: apoptotic and other anti-aptototic. The latter is mediated by the transcription factor NF-KB which is a central mediator for the gene expression induced in cells by pathogens or inflammatory cytokines, and is known to play an important role in development of the immune system. It has been recently shown NF-KB activates an anti apototic response by inducing gene transcription. The aim of our experimental work is to isolate and characterise NF-KB-inducible genes whose protein products have an anti-apoptotic function.
Training content (objective, benefit and expected impact)
To achieve our objectives, a TNF responsive cell line containing an inducible inhibitor of NF-KB will generated. When the NF-KB inhibitor alpha (a transdominant negative version resistant to signal induced proteolvsis) is induced and the cells exposed to TNF, apotosis will be triggered. In the absence of inhibitor, NF-KB will be induced and transcription of the anti-apoptotic genes will protect the cell from the TNF induced apoptosis. Comparision of the mRNA populations in the presence or absence of IkBa should permit identification of NF-KB inducible genes. Cells expressing the IKBa mutant under negative control of the tetracycline (tet) represor will remain viable in the presence of tet (NF-Kb activated), but will become apoptotic in the absence of tet (NF-KB inhibited). Once an appropriate cell has been identified it will be exposed to TNF and PolyA+ RNA extracted from cells which have expressed the transdominant IKB inhibitor and viable cells in which NF-KB is activated due to repression of the inhibitor gene. mRNAs induced by NF-KB will be isolated by subtractive hybridization using suppression PCR. cDNAs will be labelled and used as hybridization probes to screen a kZAP cDNA lybrary. Additionally cDNAs will be cloned into a conventional vector and sequenced. Known NF-KB induced genes will be discarted and unidentified genes will be further investigated. If those genes products anti-apoptotic activity, they should block apoptosis in TNF treated cells. The study of clAP2 and c) proteins implicated in the modulation of the NF-KB activity and their role on the regulation of its apoptotic activity will be also performed. Links with industry / industrial relevance (22)
The host laboratory has colaborations with Pfizer Central Research to search compounds with antiinflammatory activity which inhibit NF-KB.The role of these compounds on anti-apoptotic genes will be tested.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
KY16 9TS St Andrews
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.