Objectif
As an EC funded programmewe have established the use of cloned telomeres to produce single chromosome hybrids containing terminal deletions of the long arm of the X chromosome (TACF, Nature Genetics 2 275). These hybrids are stable, easily propagated and can provide a source of additional mapped markers for the chromosome being deleted.
Rapid progress in genome analysis has resulted in almost complete YAC Contig maps of two small chromosomes, a large fraction of the human genome present in unassigned contigs, a rapidly improving genetic map and may thousands oE anonymous cDNA partial sequences. Assembly of this data into an integrated whole is the next stage of the process. For small chromosomes much of this task can be accomplished on YAC contigs of the whole chromosome. In the case of larger chromosomes our technology of chromosome fragmentation, producing a distributable resource of terminally deleted chromosomes, will provide a means of giving a chromosomal order to YAC or cosmid contigs assembled by comparison of their restriction profiles. Southern blots of such hybrid cell panels can also be used to provide map locations for cDNAs without the intricacies of in situ hybridization or the expense of PCR primer synthesis. our approach to the creation of hybrids is particularly necessary in the case of Chromosome 1 because of a dearth of existing hybrid lines. In a rodent/human hybrid line we will target +/- selectable markers to the angiotensinogen locus in 1q42-43 and to the G418 gene present on distal chromosome lP. This will provide counterselectable markers on both arms of the chromosome. Following back selection, broken chromosomes will be rescued and stabilised by the introduction of cloned telomeres. The products of breakage will be analysed by in situ hybridization to check the chromosomal integrity of each cell line.
In cooperation with Genethon we will select YACs using previously genetically mapped CA repeat sequences and use in situ hybridization to map them within the panel of deletion hybrids. These YACs, selected to be un rearranged, will then provide anchor and orientation sites for YAC contigs developed by others. Southern blots for panels of hybrids will be made and used for mapping cDNAs to establish the utility of this approach.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
EH4 2XU EDINBURGH
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.