Objetivo
- Objectives To research the genome structure and differences in response to environmental stimuli of selected strains of M tuberculosis which differ in their clinical characteristics (standard laboratory strain H37Rv; a strain which has recently caused a major outbreak of tuberculosis in the UK and a strain from South India which has been shown to have a large number of genomic deletions). These strains will be compared in different terms: - Genomic comparisons: DNA will be extracted and compared firstly by DNA micro array analysis. This will reveal the identity and extent of any deletions in the two clinical isolates, compared to the reference strain, H37Rv. In order to investigate whether there are genes present in the clinical strains which are absent in the reference strain, we will use subtractive DNA hybridization and PCR. Subtracted DNAs will be directly inserted into cloning vectors, sequenced, and sequences novel to the clinical strains identified.
- Infectivity and interactions with host cells: The strains will be compared for their ability to produce progressive infections in mice using a standard intravenous infection model and for their ability to infect and grow within both murine and human macrophages.
- Comparison of gene expression: The transcriptional response of these strains following exposure to a range of environmental stresses will be investigated using the DNA M tuberculosis micro array. The gene expression analysis is performed by doing a competitive hybridization between cDNA prepared from the bacteria exposed To the stress and that prepared from the bacteria grown under conventional conditions.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica neumología tuberculosis
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Datos no disponibles
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
NW7 1AA London
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.