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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2022-12-23

Computer-aided synthesis of new protein molecules

Objetivo



This research addresses questions raised by attempts to design proteins de novo. Such polypeptides are often compact and they have a pronounced secondary structure as a rule, but a definite organisation of side chains is usually, but not always, absent. The thermodynamics of forming a protein-like structure involves competition between the favourable hydrophobic and the van der Waals effects of forming a tightly packed core versus the unfavourable entropic effect of restriction conformation. Rules for these effects to guide the systematic design of proteins are required. It will then be necessary to show that these rules can be applied to guide the synthesis of a folded protein-like molecule.

The objectives of the research are firstly, to provide the basis for the rational design of novel proteins based on the selection of residues suitable to favour thermodynamically the folded conformation, with two aspects to be considered: the close packing of residues between secondary structures compatible with a core that excludes solvent and is favoured by the hydrophobic effect; and the effect of restricting side chain mobility and its effect on the conformational entropy of protein folding.

Secondly, guided by the empirical rules the sequence of Albebetin that has previously been synthesised and expressed in milligram quantities will be examined to suggest changes that might lead to the formation of a solid core in the folded protein; and finally, other sequences of novel proteins for synthesis will be designed.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

Datos no disponibles

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

Datos no disponibles

Coordinador

Imperial Cancer Research Fund (ICRF)
Aportación de la UE
Sin datos
Dirección
44 Lincoln's Inn Fields
WC2A 3PX London
Reino Unido

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Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos

Participantes (3)

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