Objectif
This project will investigate molecular and physical (chromosomal) organisation and evolution of nuclear repetitive DNA sequences in the plant family Solanaceae, which contains important sources of food crops and medicinal alkaloids. The information gained will be used, first, as an indicator of phylogenetic relationships among species and genera of Solanaceae and, secondly, to provide an insight into the role of repetitive DNA sequences in plant genome structure, function and evolution. Sequences from the ribosomal gene clusters, highly repeated (satellite) DNAs and dispersed repetitive sequences from Solanum and Nicotiana will be used to obtain PCR-derived probes to locate related DNA fragments in the genomes of different species and genera. The fragments will be cloned and their sequence and organisation compared in a variety of Solanaceae, particularly at the species level and below. The sequences obtained will contribute to the number of individual repetitive DNA sequences and categories of repeats known for plants and for eukaryotes as a whole.
In situ hybridisation (ISH) of the cloned repeated sequences to chromosomes will allow a comparison of physical organisation of the repeated sequences (e.g. whether in euchromatin or heterochromatin). ISH will also enable genome interaction in natural and artificial hybrids to be monitored and will determine the spread of different repeated sequence families across linkage groups within and among genotypes, species and/or genera after natural speciation processes or artificial selection.
Co-operation between the four institutes involved, and the combined use of their different expertise and plant materials, will greatly increase the speed at which sequence analysis can proceed and the depth of comparisons that can be achieved for the genomes of different genera and species of Solanaceae. In particular, it will allow the relative organisation of a wide spectrum of genomes to be covered, especially those of small, rarely studied genera and unusual hybrid species combinations.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Données non disponibles
Coordinateur
TW9 3DS Richmond
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.