Objetivo
Purpose of the biogrid project is to conduct a trial for the introduction of a grid approach in the biotechnology industry.
This trial consists of two major steps:
(i)the integration of three existing technologies and
(ii) the production of a working prototype.
The existing technologies to be integrated are:
(i) PSIMAP agent technology
(ii) classification server: Automatic model classification
(iii) space explorer: knowledge visualisation technology.Bio Grid will change the perspective of biologists from a partial view of biological data towards a holistic view of documented data seamlessly integrated with expression and interaction data. This constitutes the basis of a next generation research infrastructure for large proteomics and genomics databases.
Objectives:
The project is focused at the development of an information and knowledge grid allowing knowledge discovery and access to multiple types of unstructured data.
Scientific objectives:
Effective concept recognition, pattern matching, intelligent data sourcing agents and tagging technology;
Automated categorisation in a metadata hierarchy of the specified biotechnology research domain;
Detailed functional knowledge management interoperability methodology design;
Domain knowledge mapping, implementing a logical domain ontology;
Effective integration of agent, classification logic and visualisation technology. Business objectives: Information grid supporting a next generation classification research infrastructure for large proteomics and genomics databases; Efficient transnational enterprise collaboration;
Faster time to market biotech innovation.
Work description:
This section describes the project work plan towards realisation of the objective: to conduct a trial for the introduction of a grid approach in the biotechnology industry.This trial consist of two major steps: (i) the integration of three existing technologies and (ii) the production of a working prototype.
The project is focused at the development of an information and knowledge Grid allowing knowledge discovery and access to multiple types of unstructured data, effectively visualised and accessible in a structured data model. In the initial phase of the project, the required biotechnology domain is analysed and existing structures and standards are identified in WP1.WP2 uses the results of WP1 to create a logical structure (hierarchy) of the information structure (ontology) of the scientific area. Also the algorithms by which the data from the identified data source in WP1 can be positioned in the hierarchy is being developed in WP2. In the second phase of the project the three existing technologies (Classification Server, PSIMAP and SpaceExplorer) are integrated consecutively to the common data structure defined in WP2 This involves implementing the logic developed in WP2 in the existing agent technology used to source relevant data and position it in the developed taxonomy. WP4 is concluding with a working prototype of the agent technology. Wp5 implements existing visualisation technology to present the data structure to the users in an easy accessible manner. The second phase is concluding with a fully functional second prototype to conclude the project. In the third phase, WP6, validates the project. In this work packages metrics are introduced for technical, organisational and business parameters together with the activities for collection and evaluation of resulting data. Finally, dissemination and exploitation of the project results are addressed in wp7.
Milestones:
The end result of the project will consist of a working prototype of a next generation classification research infrastructure for biotech knowledge interoperability. This consists of (i) automatic classification in a hierarchy metadata repository (ii) intelligent agent sourcing system (iii) accessible visualisation user interfaces.
Major deliverables are: month 6 integration requirements report; month 16 Evaluation of 1st prototype; month 20 Final functional prototype.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información inteligencia artificial
- ciencias naturales ciencias biológicas genética
- ciencias naturales informática y ciencias de la información ingeniería del conocimiento ontología
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales informática y ciencias de la información base de datos
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Datos no disponibles
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
9712 CP GRONINGEN
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.