Objectif
New nuclear magnetic resonance (NMR) methods have been developed for the investigation of the solution conformation of glycoprotein oligosaccharide and the techniques have been applied to the most important N-linked oligosaccharides belonging to the family of oligomannoses.
The use of carbon-13 NMR spectroscopy has been explored on substrate at isotopic natural abundance in order to obtain supplementary experimental parameters directly correlated to the torsion angles Phi and Omega about the glycosidic linkage, namely 1-bond carbon hydrogen coupling constants and multiple bond carbon hydrogen coupling constants. Some new 2-dimensional and 1-dimensional proton detected NMR experiments were carried out which were specifically designed for carbohydrates. All the pulse sequences were successfully tested on model compounds and allowed the quantitative extraction of the interglycosidic heteronuclear long range coupling constants. The exploitation of selective NMR techniques such as soft shaped pulses or chemical shift selective filtration (CSSF) turned out to be a powerful tool to improve the sensitivity of the outlined methods. Advantages and drawbacks of 2-dimensional and 1-dimensional methods, with and without implementation of soft pulses were discussed. The validity of the proposed approach based on new proton detected 2-dimensional and 1-dimensional heteronuclear NMR experiments for conformational studies on oligosaccharides was confirmed by the measurements of 1-bond carbon hydrogen coupling constants and multiple bond hydrogen coupling constants on some members of the family of oligomannoses extracted from ribonuclease B, bovine tyroglobuline and soybean agglutinine. It was therefore demonstrated that modern heteronuclear techniques for the study of the conformational behaviour of complex oligosaccharides are successfully applicable to biologically relevant substrates. This opens new perspectives for the comprehension of the 3-dimensional structure of oligosaccharides and glycoproteins in solution.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie spectrométrie d’absorption
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule glucides
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Données non disponibles
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
OX1 3QU OXFORD
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.