Regulación epigénica de los genes a través de Elongator en plantas expuestas a iluminación variable
La transcripción es un proceso vital para la producción de productos génicos funcionales como proteínas o ARN. La ARN polimerasa II (ARNP) controla la transcripción para inciar la expresión génica y transferir la información del ADN al ARN. Elongator se asocia a la ARNP y permite el proceso de elongación en la transcripción mediante la modificación de las histonas. Las histonas son proteínas que se asocian al ADN en el núcleo celular y facilitan la estabilidad de la estructura cromosómica. A pesar de que Elongator es un regulador positivo del crecimiento de las plantas, se conoce poco sobre sus genes diana y sus interacciones con proteínas. El equipo del proyecto LIGHTER, financiado con fondos comunitarios, investigó el papel y las interacciones de Elongator durante la transcripción en plantas expuestas a diferentes tipos de iluminación. Se utilizó el ensayo de hipocótilos para evaluar la respuesta ante la oscuridad, la luz roja, roja lejana y azul. Los científicos de LIGHTER analizaron y compararon las plántulas de plantas que presentaban cepas mutantes de Elongator con plantas genéticamente intactas utilizando micromatrices para analizar el transcriptoma (totalidad de ARN de una célula). Las plántulas mutantes se caracterizaron en función de su estructura y forma así como de su respuesta ante la luz. El estudio del desarrollo de la planta en la oscuridad y con luz permitió identificar los genes sensibles a la luz afectados por Elongator. Los resultados revelaron también los mecanismos de interacción de Elongator con los fotorreceptores (como los fitocromos A y B) y las vías de señalización asociadas. La purificación de afinidad en tándem (TAP) seguida de la espectrometría de masas permitieron identificar cincuenta posibles proteínas que interaccionaban con Elongator como proteínas de unión a ARN, subunidades del proteasoma 26S y proteínas relacionadas con la luz. Se espera que los resultados del proyecto permitan conocer la regulación epigenética de los genes en las plantas expuestas a diferentes tipos de iluminación debido a alteraciones de las histonas por Elongator. Conocer el papel de Elongator y sus interacciones con proteínas, fotorreceptores y vías de señalización inducidas por la luz facilitará la creación de modelos precisos. Es posible que se lleguen a describir de forma precisa procesos esenciales como el ritmo circadiano, la fotomorfogénesis, la fotosíntesis y el desarrollo de la hoja.
