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A combined experimental and computational approach for quantitative and mechanistic understanding of transcriptional regulation

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Previsioni per i prodotti di trascrizione genica

Ad oggi, i ricercatori sono riusciti solo a descrivere i modi in cui una cellula controlla quando e dove un gene viene trascritto qualitativamente. Ora, con il finanziamento dell’UE, al controllo della trascrizione è stato dato un trattamento quantitativo.

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La regolazione trascrizionale si trova proprio al centro di sviluppo sostenibile e differenziazione. Recenti strumenti di ricerca genomica high-tech hanno portato alla luce fattori di trascrizione, elementi di regolazione del DNA e altri elementi costitutivi coinvolti in numerosi sistemi specifici. Tuttavia, la descrizione dei percorsi e della chimica in gioco è avvenuta sempre su base qualitativa. Il progetto TRANSCRIPTION_REG (A combined experimental and computational approach for quantitative and mechanistic understanding of transcriptional regulation) ha sviluppato una comprensione meccanicistica di tutto il processo. I risultati di applicazione del modello hanno dimostrato capacità predittiva. Date le sole informazioni di genotipica umana, i risultati sono stati tradotti con successo in profili di livello di espressione. Sezionare il processo di regolazione comprende un percorso di eventi cruciali. La base di tale percorso è il fatto che ogni sequenza di regolamentazione ha un unico insieme di configurazioni di legame molecolari e prodotti di trascrizione. I processi comprendono l’espressione iniziale dei fattori, l’abbinamento di regolazione cis alla sequenza appropriata e gli schemi di espressione che seguono. I ricercatori del progetto sono andati oltre la descrizione qualitativa dei fattori coinvolti e hanno ottenuto una comprensione quantitativa di come i programmi di trascrizione siano codificati nella sequenza del DNA. Le applicazioni sono di vasta portata in quanto la comprensione dei diversi fenotipi derivanti dalla variazione genetica ha vaste implicazioni nel campo della genetica medica, dell’agricoltura e delle biotecnologie in generale.

Parole chiave

Trascrizione genica, regolazione, configurazioni di lega, genetica medica

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