Rozwiązanie problemu lekooporności w UE
Europejczycy stają się coraz bardziej podatni na infekcje bakteryjne, częściowo dzięki rosnącej lekooporności. Do zwalczania takich infekcji potrzebne są innowacyjne terapie, w szczególności w przypadku tych wywołanych superbakteriami Gram-ujemnymi. Finansowany ze środków UE projekt AEROPATH ("The identification, characterisation and exploitation of novel gram-negative drug targets") wybrał bakterię pałeczki ropy błękitnej (P. aeruginosa) jako modelowy system i cel. Bakterie te są przyczyną około jednej dziesiątej infekcji powstałych podczas pobytu w szpitalu. Są one zdolne do przetrwania w różnych warunkach i są oporne na wiele środków bakteriobójczych oraz wszystkie powszechnie stosowane antybiotyki. Ponadto bakteria P. aeruginosa posiada wysoką zdolność do adaptacji i rozwijania oporności na antybiotyki, co czyni proces leczenia jeszcze trudniejszym. Początkowo w ramach projektu AEROPATH zbadano biologię bakterii P. aeruginosa na poziomie molekularnym. Dzięki hamowaniu wysokowartościowych celów terapeutycznych zidentyfikowano kanały, które osłabiają lub zakłócają zdolność bakterii do przetrwania i wywoływania infekcji. Następnie przebadano genetycznie ponad 35 wyselekcjonowanych białek, aby zbadać ich przydatność do roli miejsc docelowych działania leku. Niektóre cele wykazywały niewielki potencjał w zakresie dotyczącym opracowania nowego leku, co pomogło zespołowi projektu AEROPATH ustalić skuteczną hierarchię badań nad kluczowymi białkami na wczesnym etapie prac projektu. Umożliwiło to naukowcom nie tylko wykonanie proponowanego programu projektu, ale również przeprowadzenie większej ilości badań dotyczących wysokowartościowych celów niż początkowo zakładano. W rezultacie projekt znacząco wzbogacił obecną wiedzę naukową w zakresie celów leku przeciwko bakterii P. aeruginosa oraz zaowocował opracowaniem nowych narzędzi służących do odkrycia docelowych leków przeciwbakteryjnych. Grupa zmutowanych szczepów bakterii P. aeruginosa oraz mysi model infekcji płuca są obecnie dostępne dla potrzeb przyszłych badań. Istnieje również potencjał do rozszerzenia podejścia poza ramy projektu AEROPATH oraz bakterię P. aeruginosa na inne choroby zakaźne. Baza danych projektu zapewnia wzorzec w zakresie najlepszego wyboru innych genomów czynników chorobotwórczych w celu szybkiej identyfikacji i określenia hierarchii celów najbardziej podatnych na terapię. Ponadto utworzono skuteczną i niedrogą metodę badań przesiewowych bibliotek związków przeciwko bakteriom Gram-ujemnym.