Une approche fondée sur les connaissances pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens La résistance aux antimicrobiens (RAM) est responsable de 15 fois plus de décès que le sida chaque année. Des chercheurs de l'UE se penchent sur les vecteurs génétiques de résistance des microbes, l'intégron. Santé © Thinkstock Les intégrons sont des plateformes de recrutement génétique très efficaces que l'on retrouve dans les éléments génétiques mobiles comme les plasmides. Ils constituent donc des acteurs incontournables dans la lutte contre la RAM. Le projet ICADIGE (The integron cassette dynamics and the integrase gene expression) a étudié la dynamique moléculaire de l'intégron et de l'enzyme responsable de l'intégration d'autres gènes, l'intégrase. Les chercheurs ont travaillé avec des gènes et leurs produits qui permettent l'insertion des cassettes de gènes, dont le gène int1 qui code une enzyme appartenant à la famille des intégrases et une séquence attC adjacent au site d'insertion des cassettes. Elle permet également que d'autres cassettes soient intégrées au site attI. Pour explorer les possibilités évolutives de la protéine intégrase, les chercheurs ont codé de nouveau le gène int1 dans deux gènes alternatifs bien que synonymes. Les mutations ont été soumises à des expériences d'évolution dirigée. Capables d'identifier les fréquences des différentes mutations, les chercheurs ont également caractérisé les données structurelles sur les contraintes de la réaction. En observant l'évolution des trois gènes en parallèle, ICADIGE a incité des éléments d'évolution parallèle et convergente, des interactions épistatiques où les allèles des mutations masquées affectent les autres et la ré-évolution des résidus d'acides aminés. Comprendre les éléments de la RAM pourrait entraîner le développement de molécules qui stopperait le processus de recombinaison qui entraîne la production de nouvelles mutations pour la résistance. Les protéines clés au processus qui avaient été isolées peuvent être cristallisées pour d'autres examens sur leur rôle dans la RAM. Mots‑clés Résistance aux antimicrobiens, intégron, intégrase, expression génétique, évolution dirigée
