Les systèmes optiques de la biologie développementale en synergie
La microscopie sélective du plan d'illumination (SPIM), fonctionnant grâce à la fluorescence des protéines dans un échantillon, peut imager des processus développementaux in vivo avec un sectionnement optique haute résolution rapide. La SPIM ne peut pas imager des structures au-delà du tissu signalé, or elle peut être complétée par une technique appropriée appelée tomographie à projection optique (OPT). Un système multimodal qui exploite les caractéristiques de SPIM et OPT n'a pas été précédemment totalement exploré. Le projet SPIMTOP (Combined selective plane illumination microscopy and optical projection tomography for in vivo quantitative imaging of the developing zebrafish vasculature.), financé par l'UE, a combiné ces deux systèmes. Les chercheurs ont mis au point une méthode d'analyse des données afin de produire une carte dynamique détaillée du système vasculaire en développement du poisson zébré. La combinaison des deux systèmes a révélé une limitation étant donné que l'OPT nécessite une longue profondeur de champ et la SPIM profite d'une gamme étroite. Surmontant ce problème technique sans modifier le logiciel, SPIMTOP a pris une pile d'images de transmission afin de créer un ensemble de données pour la reconstruction tomographique. La nouvelle méthode peut être aisément adoptée par un grand nombre de systèmes dont les microscopes commerciaux optiques. Les chercheurs ont également développé un programme en temps réel. Ce dernier enregistre uniquement les données pertinentes pour la reconstruction, est compatible avec une imagerie in vivo et une observation en accéléré du développement et intègre également bien l'enregistrement rapide SPIM. La biologie développementale est un domaine en croissance constante notamment avec la contribution de l'expression génique aux données morphologiques. La technologie SPIMTOP élargira les horizons pour le développement de l'imagerie quantitative des organismes translucides tels que le poisson zébré. Les innovations du projet promettent de conférer un avantage concurrentiel à la recherche de l'UE.
Mots‑clés
Biologie développementale, système optique, microscopie sélective du plan d'illumination, tomographie de projection optique, observation en accéléré
