El control espaciotemporal de la expresión génica
Las células de la sangre y del sistema inmunitario se originan a partir de un progenitor común, las células madre hematopoyéticas (CMH), que residen en la médula ósea. La diferenciación de CMH en células sanguíneas e inmunitarias maduras depende del tipo celular y la expresión genética específica del estadio de desarrollo. Esto se logra a través de la acción conjunta de factores de transcripción que se unen a promotores, potenciadores y otros elementos reguladores del genoma. Los promotores están ubicados próximos a genes, mientras que los potenciadores están localizados de una manera mucho más esporádica y, a menudo, bastante lejos de los genes diana. Numerosos indicios señalan que el contacto entre potenciadores y promotores distales está mediado por el empaquetamiento la cromatina, que acerca estas regiones y facilita la unión de factores de transcripción. El objetivo del proyecto financiado por la Unión Europea GENOMIC INTERACTIONS (B-cell development and gene regulation in three dimensions) era mapear las interacciones entre promotores y potenciadores durante el desarrollo hematopoyético. Para tal fin, los investigadores llevaron a cabo un análisis genómico de las CMH y de las células a las que dan origen empleando la inmunoprecipitación de cromatina seguida de secuenciación y plataformas de secuenciación de ARN. Los datos generados permitieron crear mapas de potenciadores de células B así como del desarrollo de células mieloides y mapas de cromatina desplegada y perfiles de expresión de ARN. Los resultados revelaron un claro preestablecimiento de potenciadores relacionados con células B en células progenitoras hematopoyéticas tempranas que, sin embargo, permanecían funcionalmente inactivas. Trabajos adiciones en modelos murinos deficientes para factores de transcripción son necesarios para caracterizar de manera precisa la contribución de estos potenciadores al desarrollo linfoide temprano. Finalmente, el equipo desarrolló un protocolo para el mapeo de interacciones entre promotores y potenciadores a nivel de todo el genoma empleando unas pocas células. En conjunto, los descubrimientos del estudio proporcionan una mejor comprensión sobre cómo las redes transcripcionales rigen la progresión del desarrollo celular con respecto a la diferenciación de las células B, especialmente en el marco de interacciones genómicas amplias que median el contacto entre promotores y potenciadores. Además, los resultados indican potenciales repercusiones funcionales de variantes génicas en regiones relacionadas con rasgos genéticos complejos o enfermedades hereditarias.
Palabras clave
Elemento regulador, factor de transcripción, empaquetamiento de la cromatina, GENOMIC INTERACTIONS, célula B
