De nouveaux essais in silico visent à accélérer le développement d’un vaccin contre la tuberculose
La tuberculose est l’une des maladies les plus mortelles de la planète, tuant 1,6 million de personnes en 2021. Si la plupart des cas de tuberculose sont recensés dans les pays en développement, les pays développés n’y sont aucunement immunisés. En fait, l’augmentation de la tuberculose multirésistante amplifie la menace d’une épidémie mondiale. Si quelques signes indiquent qu’un vaccin pourrait contribuer à renforcer la réponse du système immunitaire à la maladie, les coûts élevés et les longues périodes d’essai ont freiné le développement d’un tel vaccin. Et si la technologie était la clé de la rationalisation de ce processus tout entier? C’est précisément ce que le projet STriTuVaD(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre), financé par l’UE, avait l’intention de découvrir. «Afin de lutter contre cette horrible maladie, nous voulions créer les simulations informatiques et les patients virtuels nécessaires pour accélérer le développement, les essais et l’approbation d’un vaccin très prometteur», explique Epifanio Fichera, responsable du projet rattaché à Etna Biotech(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre), partenaire principal du projet. La validation du modèle informatique prospectif de ce projet est réalisée en parallèle à la phase IIb des essais cliniques randomisés en double aveugle du vaccin RUTI®, l’un des vaccins thérapeutiques les plus avancés contre plusieurs formes de tuberculose.
Essais in silico
Traditionnellement, le développement de vaccins passe par la réalisation de plusieurs essais cliniques visant à en déterminer l’innocuité et l’efficacité, processus qui peut prendre des années et coûter des millions. «Les essais in silico, pour leur part, permettent de simuler les effets d’un vaccin dans un environnement virtuel, ce qui peut aider les chercheurs à identifier les candidats vaccins les plus prometteurs à un stade précoce du processus de développement», fait remarquer Epifanio Fichera. Afin de mettre en place son essai in silico, le projet a d’abord utilisé le cadre de modélisation UISS (Universal Immune System Simulator) préexistant, qui est capable de reproduire la dynamique du système immunitaire humain à grande échelle. Ensuite, des chercheurs de l’université de Catane(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre), épaulés par des experts de TBVI(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) et tous les autres partenaires du projet, ont élargi le modèle UISS afin de simuler l’interaction entre la tuberculose et le système immunitaire. Cette plateforme élargie a non seulement permis aux chercheurs de simuler l’immunité artificielle induite par les vaccinations et les traitements contre la tuberculose, mais aussi de créer une bibliothèque de sujets virtuels et de patients vaccinés virtuels. Parallèlement à ces travaux, des chercheurs de l’université de Sheffield(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) se sont attachés à élaborer un modèle bayésien capable de combiner les données de patients réels avec celles des patients virtuels susmentionnés. Ces données ont ensuite été intégrées à la plateforme STriTuVaD pour permettre aux utilisateurs de prédire les effets d’une thérapie combinée à long terme.
Des résultats initiaux prometteurs
Archivel Farma(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ayant achevé la fabrication et le test d’un lot clinique de son vaccin RUTI®, il était temps de découvrir ce dont la plateforme STriTuVaD était capable. Alors que l’AIIMS(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) a mené l’essai clinique de phase IIb, l’université de Catane a utilisé la plateforme pour le reproduire virtuellement, en testant le vaccin contre la tuberculose pharmacosensible et la tuberculose multirésistante. En parallèle, l’université de Bologne(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) a remédié aux obstacles réglementaires de l’approche in silico. La cohorte de tuberculose pharmacosensible n’a fait état d’aucun effet indésirable grave découlant de l’utilisation du vaccin et l’étude consacrée à la tuberculose multirésistante va bon train. Les résultats sur l’efficacité de l’étude clinique seront publiés prochainement. Fort de ces premiers résultats prometteurs, ainsi que de leur vérification et validation, la plateforme d’essai in silico STriTuVaD a été rendue disponible sous la forme d’un logiciel en tant que service. «La mise à disposition générale de la plateforme d’essai in silico STriTuVaD pour prédire l’efficacité d’un vaccin contre la tuberculose est susceptible de révolutionner le développement de vaccins», conclut Epifanio Fichera. «Elle constitue un jalon passionnant et significatif dans la lutte contre la tuberculose et d’autres maladies à prévention vaccinale.»
Mots‑clés
STriTuVaD, essais in silico, tuberculose, vaccin contre la tuberculose, vaccin, TB, maladie
