Métodos genómicos para mejorar la crianza del ganado
La información genómica —los datos celulares que necesita un organismo para crecer y funcionar— lleva tiempo analizándose y utilizándose para criar ganado más resiliente y sano. Uno de los principales inconvenientes es que aún no se conocen bien los mecanismos biológicos que subyacen a determinadas variantes genéticas. Por lo tanto, las consecuencias para la salud y el bienestar del ganado pueden ser imprevisibles, ya que ciertos rasgos genéticos pueden tener efectos secundarios imprevistos. El equipo del proyecto BovReg pretendía avanzar hacia un método más basado en la biología, en el que se comprendiera mejor la función de una variante genética específica. «Sigue siendo una gran incógnita», afirma la coordinadora del proyecto BovReg, Christa Kuehn, que actualmente trabaja en el Instituto Friedrich-Loeffler (Alemania). «Sin embargo, sabemos que más del 95 % del genoma que no se traduce en proteínas debe tener alguna función, de lo contrario la evolución no lo habría transmitido durante millones de años».
Investigación de las regiones reguladoras del genoma
Kuehn y sus homólogos querían investigar estas regiones reguladoras del genoma. Para descubrir dichos mecanismos, el equipo del proyecto, coordinado por el Instituto de Investigación de Biología de Animales de Granja (Alemania), generó enormes cantidades de datos funcionales compartidos sobre el genoma a partir de tejidos bovinos y líneas celulares de uso frecuente. El objetivo era establecer un conocimiento mucho más detallado de los rasgos relacionados con la robustez y la salud del ganado vacuno. Con este fin, el equipo del proyecto también desarrolló canales bioinformáticos para garantizar que el análisis de los datos fuera reproducible e interoperable en distintas plataformas. «También se generó una enorme cantidad de datos utilizables para la investigación biomédica», explica Kuehn. «Queríamos asegurarnos de que esta información fuera utilizable y accesible». Todos los datos se introducirán en un portal de datos público mundial. «También llevamos a cabo un mapeo ético para trazar las percepciones sociales de la mejora genómica», añade Kuehn. «La investigación puede causar, a veces, trastornos o reticencias sociales, así que queríamos adelantarnos a los acontecimientos y ver qué posibles implicaciones podría tener para la sociedad».
Anotación funcional de genomas animales
Los resultados del proyecto BovReg también se han incorporado al proyecto mundial FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes), organización que agrupa la investigación genómica en animales de granja de todo el mundo. La comunidad FAANG opera en paralelo a la iniciativa ENCODE. Se dedica a caracterizar la función del genoma humano. El equipo de BovReg creó conjuntamente EuroFAANG, una iniciativa conjunta de seis proyectos relacionados financiados con fondos europeos que han acordado conductos de datos comunes y protocolos generales, garantizando así que los conocimientos se difundan lo más ampliamente posible. A partir de esta iniciativa EuroFAANG, se consiguieron más fondos europeos hace dos años para un proyecto denominado «EuroFAANG Research Infrastructure», que establecerá la infraestructura necesaria para continuar esta cooperación en el futuro. «Uno de los principales retos tras un proyecto como BovReg es mantener unida a las personas y garantizar la continuidad de la comunidad», afirma Kuehn.
Mejorar las prácticas de crianza del ganado
Kuehn y su equipo creen que el trabajo pionero del equipo de BovReg contribuirá a mejorar las prácticas de mejora genética. «Cuanto más sepamos sobre la función genómica, más podremos evitar los efectos secundarios perjudiciales de la mejora genética», señala. «Esto podría ahorrar recursos y mejorar el bienestar animal». Una mejor información genómica también podría conducir a una gestión animal y una intervención veterinaria más específicas. «Algunas poblaciones animales podrían beneficiarse más que otras del tratamiento personalizado», añade Kuehn. «Acercarnos a la comprensión de las funciones genómicas puede ayudarnos a entender las necesidades reales de los animales».
Palabras clave
BovReg, genómica, ganado, biológica, animal, mejora genética, FAANG
