Évaluation du potentiel des micro-organismes dans la restauration de la pollution pétrolière marine
Le projet MATBIOPOL a longuement étudié les caractéristiques physiques et biogéochimiques, les processus microbiens associés et la biodiversité dans différents systèmes de tapis. Ces informations n'ont pas seulement permis d'améliorer la compréhension des écosystèmes de tapis microbiens, mais ont en outre contribué à l'évaluation du potentiel de biodégradation par ces tapis microbiens des sédiments pollués par le pétrole. Les études menées sur les micro-organismes essentiels pour l'écosystème dans des sédiments contaminés ont fourni des informations intéressantes sur la biodiversité et la physiologie de ces organismes. Leur capacité à dégrader des hydrocarbures déterminés a en outre été évaluée grâce à des analyses chimiques réalisées sur des isolats. Les chercheurs ont utilisé des méthodes de microbiologie standard telles que des observations microscopiques pour identifier la morphologie et des méthodes biochimiques, et notamment l'utilisation de substrats, du métabolisme et d'optima spécifiques, afin de spécifier la physiologie correspondante. De manière plus spécifique, la plupart des souches d'hydrocarbures isolées ont été caractérisées et identifiées en tant que Pseudomonas spp., Acinetobacter spp. et Halomonas spp à l'aide de méthodes conventionnelles. Après comparaison des résultats avec des études moléculaires réalisées par d'autres partenaires, il est apparu que la distribution géographique des Marinobacter spp. dans les tapis microbiens était plus large qu'on ne le pensait au départ. Des études de screening ont montré que les hydrocarbures à chaîne droite pouvaient être utilisés à grande échelle comme substrats, alors que la dégradation des hydrocarbures mono-aromatiques n'était possible que dans une certaine mesure. De manière plus spécifique, les isolats de Rhodococcus offrent un plus grand potentiel de dégradation rapide des hydrocarbures individuels et de mélanges d'hydrocarbures spécifiques et pourraient dès lors être utilisés dans la production de bio-surfactants cellulaires.
