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Microbial marine communities diversity : from culture to function

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Représentation de la biodiversité microbienne marine

Une base de données représentant la biodiversité microbienne marine a été développée.

La mise en culture des microbes marins est une opération difficile à réaliser. Par conséquent, afin de mieux comprendre les conditions qui favorisent ou entravent leur croissance, une étude comparative de la richesse et de la structure de la communauté microbienne a été réalisée dans deux sites marins européens. De nombreux outils et méthodologies moléculaires ont permis de découvrir les organismes vivant dans l'eau de mer, de déterminer les facteurs qui entravent leur croissance et de développer des méthodologies appropriées au regroupement de cultures pures. Une base de données de séquences intitulée «Micro-Mar» a été créée pour représenter les microbiotes vivant dans ces environnements. Elle contient des informations sur les organismes qui se développent grâce à diverses combinaisons de régimes nutritifs. Micro-Mar permettra d'améliorer rapidement les méthodes de description de la biodiversité microbienne marine. L'objectif est de faire évoluer cette base de données en un livre virtuel interactif de la microbiologie marine. Cet outil s'avèrerait particulièrement utile aux microbiologistes marins en les aidant à intégrer des volumes importants d'informations publiées n'ayant pas encore été incorporées au domaine général de la microbiologie marine.

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