L'UE s'attaque aux bactéries résistantes
Les Européens sont de plus en plus sensibles aux infections bactériennes, en grande partie à cause de l'émergence croissante d'une résistance aux antibiotiques. Pour combattre ces infections, de nouveaux traitements sont absolument nécessaires, spécialement pour combattre celles provoquées par les super bactéries résistantes gram-négatives. Les partenaires du projet AEROPATH («The identification, characterisation and exploitation of novel gram-negative drug targets») financé par l'UE ont choisi la bactérie Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) comme système cible modèle. Ces bactéries sont responsables d'environ 10% des infections contractées lors d'un séjour à l'hôpital. Elles sont capables de survivre dans des environnements très divers et sont résistantes à de nombreux antiseptiques et à la plupart des antibiotiques. P. aeruginosa est par ailleurs une bactérie particulièrement adaptée pour développer une résistance aux antibiotiques, rendant de fait son traitement encore plus difficile. Les chercheurs du projet ont commencé par analyser la biologie de P. aeruginosa au niveau moléculaire. Ils ont ainsi pu identifier certaines voies pouvant être bloquées par inhibition de cibles thérapeutiques potentiellement intéressantes, affaiblissant la bactérie ou interférant avec sa capacité de survie et son infectuosité. Ils ont ensuite testé le potentiel thérapeutique des 35 protéines sélectionnées par les techniques de la biologie moléculaire. Certaines d'entre elles se sont rapidement révélées peu intéressantes d'un point de vue pharmaceutique, les partenaires du projet ont donc pu axer prioritairement leurs recherches sur les plus prometteuses. Cette première phase a permis aux chercheurs, non seulement d'effectuer le programme initial du projet mais également de réaliser plus de recherches sur les cibles à fort potentiel qu'envisagé au départ. Au final, ce projet a permis d'enrichir considérablement nos connaissances scientifiques actuelles sur les cibles thérapeutiques de P. aeruginosa tout en développant de nouveaux outils de recherche pour la découverte de médicaments antibactériens ciblés. Une palette de souches mutantes de P. aeruginosa et un modèle murin de la pathologie pulmonaire sont maintenant disponibles pour les chercheurs. Au-delà du projet AEROPATH et de la bactérie P. aeruginosa, la stratégie employée pourra probablement être étendue à d'autres pathologies infectieuses. La base de données du projet pourra servir de modèle pour explorer d'autres génomes bactériens et identifier et sélectionner les cibles thérapeutiques les plus facilement exploitables. Les chercheurs ont également mis au point une méthode efficace et bon marché de criblage des bibliothèques de molécules pour les bactéries gram-négatives.
