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RNA functions in parasite-host communication in the gut

Description du projet

Comment les vers parasites utilisent l’ARN pour réguler la santé de l’intestin

Chez de nombreux animaux, les vers parasites gastro-intestinaux, connus sous le nom d’helminthes, libèrent des molécules bioactives qui facilitent la tolérance immunologique et les fonctions intestinales. Les scientifiques ont récemment découvert que l’ARN est l’un des produits que les helminthes libèrent afin d’influencer les cellules hôtes de manière directe. Le projet RNACOM, financé par l’UE, entend déterminer la manière dont les helminthes utilisent cette nouvelle forme de communication ARN pour réguler l’épithélium intestinal et développer des stratégies visant à bloquer le mécanisme de communication lors de l’infection. RNACOM apportera également des connaissances quantitatives et moléculaires clés aux processus par le biais desquels l’ARN d’une espèce peut en influencer une autre, faisant avancer la biologie ARN et permettant de tester de nouvelles stratégies de contrôle parasitaire. En outre, l’initiative créera une plateforme unique pour l’identification de nouveaux réseaux de gènes qui sous-tendent les fonctions cellulaires intestinales et la santé de l’intestin.

Objectif

Cross-species communication is required for proper functioning of the mammalian gut, where different organisms share resources, coordinate digestion and maintain homeostasis. In many animals, parasitic worms (helminths) are part of this ecosystem, where they communicate through the release of bio-active molecules that promote immunological tolerance and modulate gut functions. Mechanisms of cross-species communication are still not well understood and my lab discovered that ribonucleic acids (RNA) are one of the products helminths release to directly influence host cells. The overall goal of RNACOM is to determine how gastrointestinal parasites use this novel form of RNA communication to regulate the gut epithelium and to develop strategies to block the communication mechanism during infection. We have recently discovered a specific Argonaute protein that gastrointestinal nematodes use to transmit parasite RNAs to mouse cells. We will target this protein to identify parasite-host RNA-RNA interactions that occur during chronic infection (Aim 1). We will then determine the specificity and function of parasite RNA transmission to mouse cells in the epithelium using model organoids and in vivo imaging (Aim 2) and will determine the mechanism of action of parasite RNAs in host gene suppression using synthetic and recombinant strategies (Aim 3). Finally we use genetic tools in the mouse model to determine the function of cross-species RNA-RNA interactions during infection, while testing new strategies to block RNA transmission by the parasite (Aim 4). RNACOM will bring key quantitative and molecular understanding to the processes by which RNA from one species can influence another, advancing a frontier area in RNA biology while testing new strategies of parasite control. In parallel RNACOM develops a unique platform for identifying new gene networks that underpin intestinal cell functions and gut health.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

ERC-COG - Consolidator Grant

Institution d’accueil

THE UNIVERSITY OF EDINBURGH
Contribution nette de l'UE
€ 1 993 771,00
Adresse
OLD COLLEGE, SOUTH BRIDGE
EH8 9YL Edinburgh
Royaume-Uni

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Région
Scotland Eastern Scotland Edinburgh
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 1 993 771,00

Bénéficiaires (1)