Skip to main content
Ir a la página de inicio de la Comisión Europea (se abrirá en una nueva ventana)
español es
CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS

Interrogating the diversity of gut colonization strategies in multidrug-resistant E. coli to deduce robust competitive exclusion-based treatments

Descripción del proyecto

Competencia por el mismo nicho: una nueva estrategia contra la resistencia a los antibióticos

Numerosas bacterias, como «Escherichia coli», desarrollan mecanismos para combatir el efecto de los antibióticos. Una de las estrategias que utilizan es la expresión de las betalactamasas de espectro extendido (BLEE), enzimas que descomponen la penicilina y las cefalosporinas, provocando así que resulten ineficaces contras las infecciones. Para contribuir al desarrollo de nuevos tratamientos, el proyecto financiado con fondos europeos ECOSTRAT propone estudiar la evolución de las bacterias «E. coli» productoras de BLEE. Los investigadores estudiarán la colonización del intestino de mamíferos por bacterias «E. coli» productoras de BLEE para identificar los factores determinantes y los genes. Los resultados constituirán los cimientos para el desarrollo de nuevos tratamientos basados en la competencia con otra microbiota.

Objetivo

The rise of multidrug-resistant bacteria limits the options to treat critically ill patients. In 2015, Escherichia coli producing Extended Spectrum β-Lactamases (ESBL) were the leading cause of death attributable to antibiotic resistant bacteria in Europe. The failure to address these infections using standard antibiotherapy calls for better understanding of how these bacteria evolve in order to develop new treatments.
Presence of resistance and virulence genes correlates with high prevalence in ESBL clones. Since the intestinal tract of mammals represents a major ecological niche for E. coli, gut colonization ability must have predisposed certain clones to evolutionary success during the antibiotic era. In particular, competition against the gut microbiota should select for colonization factors that predate the acquisition of resistance.
To test this hypothesis, we will compare strategies for gut colonization in ESBL clones of different prevalence in absence of antibiotics. Using mice, we will be able to modulate selective pressures exerted by the intestinal microbiota. We will compare gut colonization factors in ESBL clones by performing parallel high-throughput genetic screening in conventional mice (aim 1). We will analyze adaptability and the stability of resistance and virulence genes during long-term colonization (aim 2). Subsequent competitions in gnotobiotic mice harboring permissive microbiota will allow us to deduce functions needed for colonization in the presence of a competitive microbiota. In aim 3, we will measure the impact of competitors transmitted from cohabitant to infected mice on the duration of ESBL E. coli carriage and assess potential synergies with the adaptive immunity in vaccinated hosts.
Overall, we will unravel with unprecedented depth the general principles of intestinal colonization in ESBL E. coli, shed new light on the global success of prevalent clones and conceptualize robust antibiotic-free competition-based treatments.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

ERC-COG - Consolidator Grant

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2020-COG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

UNIVERSITAT BASEL
Aportación neta de la UEn
€ 1 993 191,00
Dirección
PETERSPLATZ 1
4051 Basel
Suiza
Región
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 1 993 191,00

Beneficiarios (1)