Descripción del proyecto DEENESFRITPL Información mecanicista sobre el reconocimiento de las dianas del factor de transcripción La transcripción génica en ARN mensajero requiere la acción concertada de los factores de transcripción (FT), proteínas que regulan la unión al ADN que pueden enlazarse a secuencias de ADN concretas. Dado el tamaño y la complejidad del genoma y el motivo de enlace pequeño de los FT, resulta intrigante cómo encuentran los lugares correctos. La hipótesis de trabajo del proyecto bInDR, financiado con fondos europeos, es que regiones específicas dentro de los FT conocidas como regiones intrínsecamente desordenadas desempeñan un papel fundamental en la especificidad de los FT. Los investigadores estudiarán el mecanismo molecular basado en las regiones intrínsecamente desordenadas y generarán un modelo de cómo los FT reconocen sus dianas «in vivo» con gran eficiencia y especificidad. Mostrar el objetivo del proyecto Ocultar el objetivo del proyecto Objetivo How transcription factors (TFs) bind rapidly at specific sites within large genomes remains a major mystery. Specificity is puzzling since TFs select a small fraction of their potential binding sites - short and highly abundant DNA motifs. Rapid detection of these selected sites is challenging due to the small motif size and the large number of non-specific sites within a genome. Despite extensive efforts, a unifying model accounting for these challenges, underlying the foundations of gene regulation, is still missing. Our recent results revealed an unexpected role of long intrinsically disordered regions (IDRs) in determining the in-vivo binding specificity of TFs. Long IDRs are ubiquitous among eukaryotic TFs, but their potential role is largely unknown. By studying two budding yeast TFs, we found that in-vivo binding specificity depends on long (>500 residues) IDRs located outside the DNA binding domains (DBDs). Furthermore, IDRs direct TF binding to the selected set of promoters using multiple weak specificity determinants distributed throughout their entire sequence. Our results suggest that TFs search for their binding sites through a two-tier process: Specificity determinants distributed within long IDRs direct TFs to broad promoter regions, allowing for subsequent localized search of the DBD for its short binding motif. We plan to establish this model by: (1) Defining the molecular basis of IDR-promoter recognition and its sequence recognition code, (2) Defining the dynamic profile of IDR-based DNA recognition, and (3) Elucidating the evolutionary implications of this novel recognition mode. Through a combination of experiments, computation and theory, carried out by an interdisciplinary group of students, our study will establish a new paradigm that explains the efficiency and specificity of the search of TFs for their in-vivo binding targets, providing a new solution for a long-standing mystery. Ámbito científico natural sciencesbiological sciencesgeneticsDNAnatural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes Programa(s) H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC) Main Programme Tema(s) ERC-2020-ADG - ERC ADVANCED GRANT Convocatoria de propuestas ERC-2020-ADG Consulte otros proyectos de esta convocatoria Régimen de financiación ERC-ADG - Advanced Grant Institución de acogida WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE Aportación neta de la UEn € 2 500 000,00 Dirección HERZL STREET 234 7610001 Rehovot Israel Ver en el mapa Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 2 500 000,00 Beneficiarios (1) Ordenar alfabéticamente Ordenar por aportación neta de la UE Ampliar todo Contraer todo WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE Israel Aportación neta de la UEn € 2 500 000,00 Dirección HERZL STREET 234 7610001 Rehovot Ver en el mapa Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 2 500 000,00
