Description du projet
Technologies chimioenzymatiques dans la recherche en glycomique fonctionnelle
La grande partie des protéines à la surface des cellules sont modifiées par des hydrates de carbone liés par covalence. Les structures glycaniques sur ces glycoprotéines servent de médiateurs pour de nombreux processus physiologiques. Il n’existe cependant pas de méthodes permettant de produire des bibliothèques de glycanes complexes afin d’étudier les propriétés biologiques des protéines de liaison aux glycanes. Le projet SWEETPROMISE, financé par l’UE, développera des technologies chimioenzymatiques qui permettront de créer des collections d’oligosaccharides de sulfate de kératane bien définis et de sialosides O-acétylés, des classes de glycanes qui demeurent mal connues. Les composés qui en découleront seront utilisés pour mettre au point un microréseau de glycanes afin d’identifier des ligands pour les protéines de liaison aux glycanes. Les propriétés biologiques des candidats identifiés dans le cadre de l’analyse des microréseaux seront examinées au moyen des réseaux cellulaires nouvellement développés. SWEETPROMISE s’intéressera tout particulièrement aux protéines immuno-régulatrices et aux virus qui exploitent souvent la surface cellulaire des glycanes pour l’infection.
Objectif
Almost all cell surface proteins are modified by covalently-linked carbohydrates and the glycan structures on these glycoproteins are mediators of many physiological and disease processes. Despite their importance, there are no methods available to systematically and efficiently produce libraries of complex glycans to investigate specificities and biology of glycan binding proteins. To address this deficiency, we will develop chemoenzymatic technologies that can provide large collections of glycans having architectures of unprecedented complexity. It will exploit chemically modified sugar nucleotide donors that can be transferred by glycosyl transferases to give products in which artificial entities will blocks specific sites from enzymatic modification. It will provide full control over branching, sites of fucosylation, sulfation and sialylation. The chemical entities will be chosen in such a way that they can be removed after a series of enzymatic transformations. The methodology will be employed to prepare a series of keratan sulfate oligosaccharides. These glycoconjugates, which are biologically still poorly understood, have been implicated a multitude of physiological and disease processes. To further broaden the scope of the technology, a chemoenzymatic methodology will be developed to prepare sialosides that at C-4, C-7, C-8 and/or C-9 are modified by acetyl esters. The compounds will be used to develop a designer glycan microarray to identify ligands for glycan binding proteins. The focus will be on immuno-regulatory proteins and viruses that exploit cell surface glycans for infectivity. Cellular arrays will be developed to examine biological properties of hits identified in the microarray screening. The results of the studies will provide critical insight about glycan complexity and recognition by self- and viral glycan binding proteins, and will provide leads for the development of immune-modulators and antiviral agents.
Champ scientifique
Programme(s)
Thème(s)
Régime de financement
ERC-ADG - Advanced GrantInstitution d’accueil
3584 CS Utrecht
Pays-Bas