Description du projet
Utilisation de microARN pour lutter contre les agents pathogènes des végétaux
Des recherches récentes ont démontré que les microARN (miARN) sécrétés par les hôtes végétaux peuvent affecter la viabilité de certains micro-organismes, y compris des agents pathogènes. Le projet RhizoMiR, financé par l’UE, examinera l’impact des miARN sécrétés par les racines des plantes sur la composition et l’expression génétique du microbiome de la rhizosphère. Le chargé de recherche effectuera des analyses métagénomiques et transcriptomiques de la rhizosphère du sol des modèles végétaux (Arabidopsis thaliana et Brachypodium distachyon) cultivés dans des conditions de laboratoire, en les appliquant également aux cultures sélectionnées qui se sont développées dans des conditions naturelles. Le spectre d’activité de certains miARN spécifiques ou combinés sera également étudié en recourant à des mutants invalidés d’A. thaliana ou en perturbant les miARN sécrétés dans des plantes sauvages grâce à une stratégie basée sur la technologie innovante des peptidases mitochondriales intermédiaires.
Objectif
An innovative strategy for sustainable ‘green’ agriculture to substitute to the use of fertilizer and pesticides is urgently needed. In plants, the micro-organisms of the rhizosphere associated with the plant root, are known to affect the physiology and the development of the plant. Therefore, modulating the microbiome of the rhizosphere may be a promising strategy to achieve sustainable green agriculture. Recent research has shown that miRNAs secreted by eukaryotic host can act as an interkingdom signal to impact the viability of specific micro-organisms, including pathogens. Therefore, this EU proposal aims to explore the impact of miRNAs secreted by the plant root on the composition and gene expression of the rhizosphere microbiome. The objectives are (1) to identify specific secreted miRNAs that may influence the rhizosphere microbiome composition, (2) to analyse the biological features of the secreted miRNA-containing vesicles, (3) to understand how specific secreted miRNAs influence microbiome gene expression, (4) to determine in natura the repertoire of miRNA and associated microbiome for selected plants of agricultural interest. A combination of metagenomic and transcriptomic analysis of the soil rhizosphere from plant models (Arabidopsis thaliana and Brachypodium distachyon) under laboratory condition, as well as with selected plants of agricultural interest in natura conditions will be undertaken. The spectrum of activity of specific, or combinations of, secreted miRNAs will be also explored using A. thaliana knock-out mutants, or by perturbation of the secreted miRNAs in the WT plant using a strategy based on innovative miPEP technology. Ultimately this research can have application for miRNA-based modulation of the microbiomes of halobionts, including plants of agricultural interest. The unique complementarity of expertise between the fellow and his supervisor, completed by a well designed training program, will allow him to take up this challenge.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
35042 RENNES
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.