Descrizione del progetto
Uso dei microRNA per combattere i patogeni delle piante
Recenti ricerche hanno dimostrato che i microRNA (miRNA) secreti dagli ospiti vegetali possono influenzare la vitalità di specifici microrganismi, compresi i patogeni. Il progetto RhizoMiR, finanziato dall’UE, studierà l’impatto dei miRNA secreti dalle radici delle piante sulla composizione e sull’espressione genica del microbioma della rizosfera. Il ricercatore effettuerà analisi metagenomiche e trascrittomiche della rizosfera del suolo di modelli vegetali (Arabidopsis thaliana e Brachypodium distachyon) coltivati in condizioni di laboratorio, applicandole anche a colture selezionate praticate in condizioni naturali. La gamma di attività di specifici miRNA secreti, o di combinazioni di essi, sarà esaminata usando anche mutanti knock-out di A. thaliana o mediante la perturbazione di miRNA secreti in piante di tipo selvatico usando una strategia basata sulla tecnologia innovativa della peptidasi intermedia mitocondriale.
Obiettivo
An innovative strategy for sustainable ‘green’ agriculture to substitute to the use of fertilizer and pesticides is urgently needed. In plants, the micro-organisms of the rhizosphere associated with the plant root, are known to affect the physiology and the development of the plant. Therefore, modulating the microbiome of the rhizosphere may be a promising strategy to achieve sustainable green agriculture. Recent research has shown that miRNAs secreted by eukaryotic host can act as an interkingdom signal to impact the viability of specific micro-organisms, including pathogens. Therefore, this EU proposal aims to explore the impact of miRNAs secreted by the plant root on the composition and gene expression of the rhizosphere microbiome. The objectives are (1) to identify specific secreted miRNAs that may influence the rhizosphere microbiome composition, (2) to analyse the biological features of the secreted miRNA-containing vesicles, (3) to understand how specific secreted miRNAs influence microbiome gene expression, (4) to determine in natura the repertoire of miRNA and associated microbiome for selected plants of agricultural interest. A combination of metagenomic and transcriptomic analysis of the soil rhizosphere from plant models (Arabidopsis thaliana and Brachypodium distachyon) under laboratory condition, as well as with selected plants of agricultural interest in natura conditions will be undertaken. The spectrum of activity of specific, or combinations of, secreted miRNAs will be also explored using A. thaliana knock-out mutants, or by perturbation of the secreted miRNAs in the WT plant using a strategy based on innovative miPEP technology. Ultimately this research can have application for miRNA-based modulation of the microbiomes of halobionts, including plants of agricultural interest. The unique complementarity of expertise between the fellow and his supervisor, completed by a well designed training program, will allow him to take up this challenge.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
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- scienze mediche e della salutemedicina di basefisiologia
- scienze agricoleagricoltura, silvicoltura e pescaagricoltura
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Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinatore
35042 Rennes
Francia