Description du projet
La caractérisation moléculaire des macrophages du foie
Les macrophages sont des cellules immunitaires spécialisées capables de phagocyter des agents pathogènes et d’activer les réponses induites par les lymphocytes T. Ils sont présents dans différents organes, y compris le poumon et le cerveau, et remplissent des fonctions spécifiques. Le projet Liver ID3ntity, financé par l’UE, se concentre sur les cellules de Kupffer, les macrophages du foie. Les chercheurs entendent déterminer les mécanismes moléculaires qui stimulent la fonction des cellules de Kupffer, ainsi que la manière dont elles sont régies par l’interaction avec les cellules hépatiques. Le projet évoluera autour d’ID3, un facteur de transcription clé de l’identité des cellules de Kupffer, et apportera des informations essentielles sur l’homéostasie et la pathologie du foie.
Objectif
Macrophages perform unique tissue-specific functions that are essential for the homeostasis of each organ. To perform these tissue-specific functions, each resident macrophage expresses a relatively unique gene expression profile controlled by specific transcription factors. Kupffer cells (KCs) are the biggest macrophage population of the body and represent 10% of all liver cells. The Guilliams lab recently reported that each KC projects an important part of its body across the liver endothelial cell barrier to be in close contact with hepatocytes. We have established that the transcription factor ID3 is highly expressed in murine KCs as compared to other macrophages, is highly preserved in KCs across 5 different species and is essential for controlling KC identity in vivo. We have recently reported that monocytes co-cultured with hepatocytes, but not with liver endothelial cells or liver fibroblasts, acquire strong ID3 expression, indicating that hepatocyte-derived signals induce ID3 expression. The objective of this proposal is to utilise ID3-expression in KCs to unravel the molecular mechanisms underlying the KC-Hepatocyte crosstalk. Since nothing is known about the hepatocyte-derived signals that induce ID3 expression in myeloid cells, I will utilize a genome-wide in vitro CRISPR screen to identify positive and negative regulators of the ID3 expression induced by hepatocytes. The result of this in vitro ID3-screen will then be combined with potential regulators predicted through epigenetic and ligand-receptor inference algorithms, to obtain our top candidates for genes involved in the liver KC-Hepatocyte crosstalk. Using cutting-edge technology combining direct guide-RNA capture with single-cell RNA sequencing, I will then perform a targeted in vivo CRISPR screen. Finally, I will knock-down the most interesting hits from this in vivo screen using CRE-Lox technology to understand the role of specific KC-Hepatocyte interactions in liver homeostasis and pathology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
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- sciences naturellessciences biologiquesbiologie cellulairesignalisation cellulaire
- sciences médicales et de la santémédecine fondamentalephysiologiehoméostasie
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Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgique