Description du projet
La sélection de l’homéostasie cellulaire et du substrat d’ubiquitine ligase E3
Les interactions faibles et transitoires entre les protéines sont essentielles à l’homéostasie cellulaire et impliquent souvent des domaines globulaires qui reconnaissent un motif linéaire court dans des régions désordonnées de protéines qui interagissent. Les ubiquitines ligases E3 utilisent ces interactions pour reconnaître leurs substrats et la conjugaison de chaînes d’ubiquitines à des signaux de substrats pour leur dégradation par le protéasome. De nombreuses ubiquitines ligases E3 jouent des rôles centraux dans la promotion de la signalisation des lésions de l’ADN et des voies de signalisation de réparation, en fournissant une protection contre des maladies sévères comme le cancer. Le projet DDRDegronDiscovery financé par l’UE entend utiliser une technique de cartographie innovante et hautement sensible des interactions entre protéines, nommée SPARK2, pour identifier des peptides dérivés du protéome désordonné basés sur leurs interactions avec des ubiquitines ligases E3, fournissant ainsi des informations sans précédent sur la maintenance de la stabilité génomique.
Objectif
Weak and transient protein-protein interactions are essential for cellular homeostasis but are challenging to study and therefore incompletely understood. Many of these interactions involve globular domains that recognize a short linear motif (SLiM) in disordered regions of interacting proteins. E3 ubiquitin ligases frequently use this principle of interaction to recognize their substrates. The conjugation of ubiquitin chains to a substrate often serves as a signal for degradation by the proteasome, and the recognized SLiM is therefore referred to as a degron. The ubiquitin system has a well-established critical function in genome stability maintenance, which is of fundamental importance for avoiding severe diseases such as cancer. A number of E3 ubiquitin ligases have key roles in promoting DNA damage signaling and repair pathways, but mechanistic insights into how these ubiquitin ligases recognize their substrates are lacking. This is due in large part to an absence of sensitive methods for discovery and characterization of transient E3 ligase-degron interactions. Here, I propose to apply and combine two novel methods in an innovative workflow to remedy this knowledge gap. I will use a powerful and highly sensitive novel protein-protein interaction mapping technique (SPARK2) to screen peptides derived from the disordered proteome for their interaction with E3 ligases important for genome stability maintenance. Detailed characterization of identified potential SLiMs interacting with DNA damage-responsive E3 ligases will subsequently be performed using MRBLE:pep, a novel multiplexing approach to simultaneously quantify dozens of protein-peptide affinities that I recently helped to develop. This in-depth characterization of E3 ligase degrons, together with functional studies of validated novel E3 ligase-substrate interactions, will enable unprecedented mechanistic insights into regulatory networks underlying genome stability maintenance.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines repliement protéique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1165 KOBENHAVN
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.