Descripción del proyecto
Un diagnóstico molecular precoz de agentes patógenos en la acuicultura
La acuicultura es uno de los sectores agroalimentarios de más rápido crecimiento del mundo y una parte integral de la bioeconomía europea. Sin la piscicultura, no habría suficientes peces para alimentar a la población mundial. Sin embargo, los peces de piscifactoría son vulnerables a las enfermedades, lo cual hace que el diagnóstico precoz sea una prioridad. El proyecto AQUASENSE, financiado con fondos europeos, desarrollará un nuevo biosensor para el diagnóstico molecular precoz de agentes patógenos en la acuicultura y evaluará el uso de la secuenciación de tercera generación para controlar los posibles reservorios de agentes patógenos. El proyecto, que empleará la acuicultura del rodaballo como caso de estudio, probará su dispositivo de detección de agentes patógenos en esta especie. El objetivo será la consecución de tratamientos más específicos y la reducción de la mortalidad y del consumo de antibióticos.
Objetivo
The aquaculture industry is essential to meet the dietary needs of the growing world population and an important contributor to the European economy and to the people’s health and welfare. However, its expansion has been limited by the great variety of diseases that affect farmed species and cause great economic losses. There is an urgent need to find new methodologies that allow cost-effective and early-detection that can be easily applied in decentralized settings or points-of-care. The main goal of AQUASENSE is the development of a new biosensor for early molecular diagnosis of aquaculture pathogens and to evaluate the use of third generation sequencing to monitor potential reservoirs of pathogens. To perform this, the turbot aquaculture will be used as a study case. A miniaturized device based on microscale solid phase extraction (µSPE) and microfluidics will be developed and optimized to perform universal highly efficient DNA extraction and purification from aquaculture samples. Then this system will be integrated with a novel biosensing module, based on isothermal amplification and CRISPR/Cas system, to develop a micro total analysis system (µTAS) suitable for resource-limited analysis. This device will be evaluated for the detection of two of the most problematic pathogens in turbot. In parallel, a miniaturized nanopore sequencer will be used to monitor the microbiome present in the samples and the potential reservoirs of pathogens, with the aid of the universal highly efficient DNA extraction device. This technology will allow more targeted treatments and reduce mortality and the use of antibiotics, improving the profitability of the sector. These objectives fit with important goals included in the Farm to Fork European Strategy (European Green Deal), such as reduce dependency on antimicrobials, improve the knowledge about microbiome and reach a more sustainable aquaculture production, all of them aimed at achieving a robust and resilient food system.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
4715-330 Braga
Portugal