Descrizione del progetto
Diagnosi molecolare precoce degli agenti patogeni nell’acquacoltura
L’acquacoltura è uno dei settori alimentari in più rapida crescita al mondo ed è parte integrante della bioeconomia europea. Senza l’itticoltura, non ci sarebbe abbastanza pesce per sfamare la popolazione globale. Tuttavia, i pesci allevati sono soggetti a malattie e ciò rende prioritaria la diagnosi precoce. Il progetto AQUASENSE, finanziato dall’UE, svilupperà un nuovo biosensore per la diagnosi molecolare precoce degli agenti patogeni nel settore dell’acquacoltura e per valutare l’utilizzo del sequenziamento di terza generazione nel monitoraggio di potenziali depositi di agenti patogeni. Prendendo come caso di studio l’allevamento dei rombi chiodati, il progetto testerà il suo dispositivo per rilevare gli agenti patogeni in questa specie. L’obiettivo è permettere trattamenti più mirati e ridurre la mortalità, nonché l’utilizzo di antibiotici.
Obiettivo
The aquaculture industry is essential to meet the dietary needs of the growing world population and an important contributor to the European economy and to the people’s health and welfare. However, its expansion has been limited by the great variety of diseases that affect farmed species and cause great economic losses. There is an urgent need to find new methodologies that allow cost-effective and early-detection that can be easily applied in decentralized settings or points-of-care. The main goal of AQUASENSE is the development of a new biosensor for early molecular diagnosis of aquaculture pathogens and to evaluate the use of third generation sequencing to monitor potential reservoirs of pathogens. To perform this, the turbot aquaculture will be used as a study case. A miniaturized device based on microscale solid phase extraction (µSPE) and microfluidics will be developed and optimized to perform universal highly efficient DNA extraction and purification from aquaculture samples. Then this system will be integrated with a novel biosensing module, based on isothermal amplification and CRISPR/Cas system, to develop a micro total analysis system (µTAS) suitable for resource-limited analysis. This device will be evaluated for the detection of two of the most problematic pathogens in turbot. In parallel, a miniaturized nanopore sequencer will be used to monitor the microbiome present in the samples and the potential reservoirs of pathogens, with the aid of the universal highly efficient DNA extraction device. This technology will allow more targeted treatments and reduce mortality and the use of antibiotics, improving the profitability of the sector. These objectives fit with important goals included in the Farm to Fork European Strategy (European Green Deal), such as reduce dependency on antimicrobials, improve the knowledge about microbiome and reach a more sustainable aquaculture production, all of them aimed at achieving a robust and resilient food system.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
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- ingegneria e tecnologiaingegneria elettrica, ingegneria elettronica, ingegneria informaticaingegneria elettronicasensoribiosensori
- scienze agricoleagricoltura, silvicoltura e pescapesca
- scienze naturaliscienze biologichegeneticaDNA
- scienze socialieconomia e commercioscienze economicheeconomia sostenibile
- scienze naturaliscienze biologichemicrobiologia
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Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinatore
4715-330 Braga
Portogallo