Description du projet
À la recherche des secrets cachés dans le code génétique de la salamandre
La perte d’un membre a d’importantes répercussions émotionnelles et physiques, ainsi qu’un impact à long terme sur les capacités motrices et fonctionnelles, ce qui affecte les individus, leurs familles et les systèmes de santé. Meilleure solution actuellement disponible, les prothèses ne sont pas exemptes de problèmes, notamment quand il s’agit d’obtenir un ajustement confortable et d’offrir un niveau de fonctionnalité supérieur. La régénération des tissus, des organes et des systèmes organiques est un domaine de recherche en pleine effervescence. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet TRANSPOLOTL établira le profil des mécanismes moléculaires à l’origine de la régénération chez les salamandres, ainsi que les forces qui ont régi leur évolution. En identifiant les changements qui ont permis l’émergence de cette capacité chez les salamandres, les chercheurs espèrent obtenir des informations pertinentes pour la médecine régénérative.
Objectif
Salamanders are unique among tetrapods in that they possess the unrestricted capacity to fully regenerate limbs upon amputation. Why is this the only tetrapod taxon harbouring such a striking regenerative potential and how did it evolve are two of the biggest outstanding questions in regenerative research. Over the past two decades, transposable elements (TEs) have emerged as one of the major drivers of regulatory evolution, and it has yet to be explored whether their spectacular numbers in salamander genomes might provide a rationale for the emergence of such an extraordinary phenotype.
The first aim of this work will be to develop an ensemble of state-of-the-art, long-read sequencing compatible approaches to profile the highly-repetitive Axolotl genome and identify the full complement of cis-regulatory-elements (CREs) driving limb regeneration. Two methyltransferase-based technologies for the profiling of chromatin accessibility and histone modifications will be developed, applied to the regenerating limb at different timepoints and later used to identify TE-derived CREs.
This approach will not only shed light on the evolution and molecular mechanisms of limb regeneration but will also set the stage for the provocative possibility of using TEs to rewire mammalian gene-regulatory-networks (GRNs) and enable regeneration. While extensively employed in a wide range of genome engineering approaches, TEs have yet to be harnessed for the regulatory rewiring of GRNs in a directed evolution context. As part of the second aim of this work, I will establish an innovative, TE-based system for the regulatory rewiring of GRNs and employ it to screen for synthetic GRNs capable of reprogramming mouse fibroblasts into a limb-bud-like state, just as it occurs during regeneration in axolotl. Ultimately, by understanding the evolutionary mechanisms behind the emergence of limb regeneration, this work aims to provide an uncharted avenue for the development of regenerating mammals.
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1030 WIEN
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.