Descripción del proyecto
Ampliación de las observaciones de FRET de moléculas pequeñas en los estudios de dinámica proteica
La dinámica conformacional de proteínas es esencial para el correcto funcionamiento y la transferencia de energía por resonancia de fluorescencia de moléculas individuales (smFRET, por sus siglas en inglés) es la técnica más adecuada para su valoración, dado que puede utilizarse en condiciones ambientales. Actualmente, la aplicación de la smFRET está limitada a causa de los breves períodos de observación y la dificultad de medir simultáneamente múltiples distancias moleculares. El objetivo del proyecto financiado con fondos europeos COSMO es desarrollar un método correlativo para ampliar las escalas temporales de observación de la smFRET e integrar múltiples mediciones en una imagen molecular coherente. El estudio combinará las mediciones de smFRET con experimentos electrofisiológicos basados en nanoporos con alta resolución temporal y sensibilidad a los cambios conformacionales. Los investigadores tienen por objetivo aplicar esta metodología para mapear la dinámica conformacional de las proteínas Ras.
Objetivo
The conformational dynamics of proteins are essential for their proper functioning, and impaired dynamics can lead to disease. However, it remains difficult to experimentally determine the multitude of conformations adopted by proteins, their lifetimes and the transitions between them. Single-molecule FRET (smFRET) is probably the most suitable technique available due to its ability to operate under ambient conditions while avoiding ensemble averaging. Yet the technique is limited by the short observation times (a few seconds) and the difficulty of measuring more than one molecular distance at the same time.
The goal of this proposal is to develop an innovative correlative approach that can extend smFRET observations to much longer timescales, while also providing a way to integrate multiple measurements into a coherent molecular picture. I will do so by combining smFRET measurements with nanopore-based electrophysiological experiments that have a high temporal resolution and are also sensitive to conformational changes. Our corelative system will thus combine the speed and the sensitivity of electrical readout with the direct observation of molecular distances using smFRET. We will apply this methodology to map conformational dynamics of the biologically-important Ras proteins. We expect that this project will allow us to develop our innovative methodology and claim the novelty of the concept. This new methodology should open entirely new opportunities to monitor fast and long-term conformational dynamics of proteins or assembly processes of macromolecules.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
3000 Leuven
Bélgica