Next generation mechanistic models of retinal interneurons

Información del proyecto

NextMechMod

Identificador del acuerdo de subvención: 101039115

DOI

10.3030/101039115

Fecha de la firma de la CE 7 Septiembre 2022

Fecha de inicio 1 Enero 2023

Fecha de finalización 31 Diciembre 2027

Financiado con arreglo a

• European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 499 860,00

Aportación de la UE

€ 1 499 860,00

Coordinado por

EBERHARD KARLS UNIVERSITAET TUEBINGEN
Germany

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Publicaciones

Peer reviewed articles (5)

GABAergic amacrine cells balance biased chromatic information in the mouse retina

Autores: Maria M. Korympidou, Sarah Strauss, Timm Schubert, Katrin Franke, Philipp Berens, Thomas Euler, Anna L. Vlasits
Publicado en: Cell Reports, Edición 43, 2024, ISSN 2211-1247
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CELREP.2024.114953

PLoS Computational Biology

Autores: Jan Lause; Dmitry Kobak; Philipp Berens
Publicado en: PLOS Computational Biology, 2024, ISSN 1553-734X
Editor: Public Library of Science
DOI: 10.1101/2024.03.26.586728

Nature Communications

Autores: Marissa A. Weis; Stelios Papadopoulos; Laura Hansel; Timo Lüddecke; Brendan Celii; Paul G. Fahey; Eric Y. Wang; J. Alexander Bae; Agnes L. Bodor; Derrick Brittain; JoAnn Buchanan; Daniel J. Bumbarger; Manuel A. Castro; Forrest Collman; Nuno Maçarico da Costa; Sven Dorkenwald; Leila Elabbady; Akhilesh Halageri; Zhen Jia; Chris Jordan; Dan Kapner; Nico Kemnitz; Sam Kinn; Kisuk Lee; Kai Li; Ran Lu; Thomas Macrina; Gayathri Mahalingam; Eric Mitchell; Shanka Subhra Mondal; Shang Mu; Barak Nehoran; Sergiy Popovych; R. Clay Reid; Casey M. Schneider-Mizell; H. Sebastian Seung; William Silversmith; Marc Takeno; Russel Torres; Nicholas L. Turner; William Wong; Jingpeng Wu; Wenjing Yin; Szi-chieh Yu; Jacob Reimer; Philipp Berens; Andreas S. Tolias; Alexander S. Ecker
Publicado en: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41467-025-58763-W

Task-specific regional circuit adaptations in distinct mouse retinal ganglion cells

Autores: Jonathan Oesterle; Yanli Ran; Paul Stahr; Jason N. D. Kerr; Timm Schubert; Philipp Berens; Thomas Euler
Publicado en: Science Advances, 2025, ISSN 2375-2548
Editor: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/SCIADV.ADP7075

eLife

Autores: Katrin Franke; Chenchen Cai; Kayla Ponder; Jiakun Fu; Sacha Sokoloski; Philipp Berens; Andreas S Tolias
Publicado en: eLife, 2023, ISSN 2050-084X
Editor: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.89996

Other (2)

Differentiable simulation enables large-scale training of detailed biophysical models of neural dynamics

Autores: Michael Deistler, Kyra L. Kadhim, Matthijs Pals, Jonas Beck, Ziwei Huang, Manuel Gloeckler, Janne K. Lappalainen, Cornelius Schröder, Philipp Berens, Pedro J. Gonçalves, Jakob H. Macke
Publicado en: 2024
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.08.21.608979

Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types

Autores: Yves Bernaerts, Michael Deistler, Pedro J. Gonçalves, Jonas Beck, Marcel Stimberg, Federico Scala, Andreas S. Tolias, Jakob Macke, Dmitry Kobak, Philipp Berens
Publicado en: 2025
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.03.02.530774

Conference proceedings (2)

Diffusion Tempering Improves Parameter Estimation with Probabilistic Integrators for Ordinary Differential Equations

Autores: Jonas Beck, Nathanael Bosch, Michael Deistler, Kyra L. Kadhim, Jakob H. Macke, Philipp Hennig, Philipp Berens
Publicado en: International Conference on Machine Learning (ICML), 2024
Editor: ML Research Press

Most discriminative stimuli for functional cell type clustering

Autores: Burg, Max F.; Zenkel, Thomas; Vystrčilová, Michaela; Oesterle, Jonathan; Höfling, Larissa; Willeke, Konstantin F.; Lause, Jan; Müller, Sarah; Fahey, Paul G.; Ding, Zhiwei; Restivo, Kelli; Sridhar, Shashwat; Gollisch, Tim; Berens, Philipp; Tolias, Andreas S.; Euler, Thomas; Bethge, Matthias; Ecker, Alexander S.
Publicado en: International Conference of Learning Representations (ICLR), 2024
Editor: OpenReview
DOI: 10.48550/arxiv.2401.05342