Descripción del proyecto
Una nueva perspectiva sobre la aparición de genes «de novo»
La investigación sobre la evolución de nuevos genes y la aparición de nuevos rasgos ha permitido identificar muchos mecanismos, como la duplicación de genes y la aparición de genes «de novo». Si bien se sabe que este último fenómeno involucra la evolución de genes a partir de secuencias de ADN que no eran génicas, aún no se comprende muy bien el mecanismo preciso en juego. El objetivo principal del proyecto NovoGenePop, financiado con fondos europeos, es comprender cómo surgen los genes «de novo» y examinar la hipótesis de que este proceso implica diferencias en el contenido de genes entre individuos. Para investigar esto, los investigadores desarrollarán nuevos métodos informáticos para evaluar todas los trascritos en diferentes sistemas biológicos e identificar posibles mutaciones que han permitido la evolución de nuevos genes.
Objetivo
Genes are fundamental units of life and their origin has fascinated researchers since the beginning of the molecular era. Many of the studies on the formation of new genes in genomes have focused on gene duplication and subsequent divergence of the two gene copies. But, in recent years, we have learnt that genes can also arise de novo from previously non-genic sequences. The discovery of de novo genes has become possible by the sequencing of complete genomes and the comparison of gene sets between closely related species. Here we wish to test a novel hypothesis, we propose that de novo gene formation dynamics in populations results in substantial differences in gene content between individuals. If they exist, these differences would be not be visible by the current methods to study gene variation, which are based on the comparison of the sequences of each individual to a common set of reference genes. To test our hypothesis, we will need to develop novel computational approaches to first obtain an accurate representation of all transcripts and translated open reading frames in each individual, and then integrate the information at the population level. We propose to apply these methods to two very distinct biological systems, a large collection of Saccharomyces cerevisiae world isolates and a human lymphoblastoid cell line (LCL) panel. For this, we will collect and generate RNA (RNA-Seq) and ribosome profiling (Ribo-Seq) sequencing data. In order to identify de novo originated events occurred within populations, as opposed to phylogenetically conserved genes that have been lost in some individuals, we will also generate similar data from a set of closely related species in each of the two systems. Combined with genomics data, we will identify the spectrum of mutations associated with de novo gene birth with an unprecedented level of detail and uncover footprints of adaptation linked to the birth of new genes.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2021-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
08003 Barcelona
España
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.