X-chromosome driven speciation through testes-expressed genes: comparative population genomics meets scRNA analysis in primates

Informations projet

Xspect

N° de convention de subvention: 101054718

DOI

10.3030/101054718

Date de signature de la CE 9 Août 2022

Date de début 1 Octobre 2022

Date de fin 30 Septembre 2027

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 499 369,00

Contribution de l’UE

€ 2 499 369,00

Coordonné par

AARHUS UNIVERSITET
Denmark

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Livrables

Documents, reports (1)

Data Management Plan

Publications

Peer reviewed articles (7)

Identification of constrained sequence elements across 239 primate genomes

Auteurs: Lukas F. K. Kuderna, Jacob C. Ulirsch, Sabrina Rashid, Mohamed Ameen, Laksshman Sundaram, Glenn Hickey, Anthony J. Cox, Hong Gao, Arvind Kumar, Francois Aguet, Matthew J. Christmas, Hiram Clawson, Maximilian Haeussler, Mareike C. Janiak, Martin Kuhlwilm,
Publié dans: Nature, 2024, ISSN 1476-4687
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41586-023-06798-8

Extraordinary selection on the human X chromosome associated with archaic admixture

Auteurs: Laurits Skov, Moise` s Coll Macia` , Elise Anne Lucotte, Maria Izabel Alves Cavassim, David Castellano, Mikkel Heide Schierup, Kasper Munch
Publié dans: Cell genomics, 2023, ISSN 2666-979X
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/J.XGEN.2023.100274

Estimating gene conversion tract length and rate from PacBio HiFi data

Auteurs: Anders Poulsen Charmouh; Peter Sørud Porsborg; Lasse Thorup Hansen; Søren Besenbacher; Sofia Boeg Winge; Kristian Almstrup; Asger Hobolth; Thomas Bataillon; Mikkel Heide Schierup
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, 2024, ISSN 1537-1719
Éditeur: Oxford Academic
DOI: 10.1093/MOLBEV/MSAF019

Eighty million years of rapid evolution of the primate Y chromosome

Auteurs: Yang Zhou  1 , Xiaoyu Zhan1 , Jiazheng Jin1 , Long Zhou  2,3, Juraj Bergman  4,5, Xuemei Li1,6, Marjolaine Marie C. Rousselle5 , Meritxell Riera Belles5 , Lan Zhao7 , Miaoquan Fang1 , Jiawei Chen1 , Qi Fang  1 , Lukas Kuderna  8 , Tomas Marques-Bonet  8,9
Publié dans: nature ecology & evolution, 2023, ISSN 2397-334X
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41559-022-01974-X

TRAILS: Tree reconstruction of ancestry usingincomplete lineage sorting

Auteurs: Iker Rivas-González ,Mikkel H. Schierup,John Wakeley,Asger Hobolth
Publié dans: PLOS Genetics, 2024, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/JOURNAL.PGEN.1010836

Characterizing the evolution and phenotypic impact of ampliconic Y chromosome regions

Auteurs: Elise A. Lucotte 1,2 , Valdís Björt Guðmundsdóttir3,4, Jacob M. Jensen1 , Laurits Skov1 , Moisès Coll Macià 1 , Kristian Almstrup 5 , Mikkel H. Schierup 1 , Agnar Helgason 3,4 & Kari Stefansson
Publié dans: Nature communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/S41467-023-39644-6

Genome-wide coancestry reveals details of ancient and recent male-driven reticulation in baboons

Auteurs: Erik F Sørensen, R Alan Harris, Liye Zhang, Muthuswamy Raveendran, Lukas FK Kuderna, Jerilyn A Walker, Jessica M Storer, Martin Kuhlwilm, Claudia Fontsere, Lakshmi Seshadri, Christina M Bergey, Andrew S Burrell, Juraj Bergman, Jane E Phillips-Conroy, Feka
Publié dans: Science, 2023, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/SCIENCE.ABN815