RNA and Cell Biology - from Fundamental Research to Therapies

Información del proyecto

RACE

Identificador del acuerdo de subvención: 101059801

DOI

10.3030/101059801

Fecha de la firma de la CE 26 Abril 2023

Fecha de inicio 1 Septiembre 2023

Fecha de finalización 31 Agosto 2029

Financiado con arreglo a

• Widening participation and spreading excellence

Coste total

€ 13 122 258,75

Aportación de la UE

€ 13 122 258,75

Coordinado por

MIEDZYNARODOWY INSTYTUT BIOLOGII MOLEKULARNEJ I KOMORKOWEJ W WARSZAWIE
Poland

CORDIS proporciona enlaces a los documentos públicos y las publicaciones de los proyectos de los programas marco HORIZONTE.

Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Resultado final

Documents, reports (1)

List of appointed members of the CAC and recruited TT and IP managers

List of appointed members of the CAC and recruited TT and IP managers (M06)

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Project website and RACE visual identity

Website and RACE visual identity: logo and design charter (M04)

Publicaciones

Peer reviewed articles (36)

Etiology of TP53 mutated complex karyotype acute myeloid leukemia

Autores: Anna Fedenko, Honorata Czapinska, Alwin Krämer, Friedrich Stölzel, Tilmann Bochtler, Matthias Bochtler
Publicado en: Leukemia, Edición 40, 2026, ISSN 0887-6924
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41375-025-02835-9

Comprehensive analysis of poly(A) tails in mouse testes and ovaries using Nanopore Direct RNA Sequencing

Autores: Agnieszka Czarnocka-Cieciura, Michał Brouze, Natalia Gumińska, Seweryn Mroczek, Olga Gewartowska, Paweł S. Krawczyk, Andrzej Dziembowski
Publicado en: Scientific Data, Edición 12, 2025, ISSN 2052-4463
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41597-024-04226-8

Journal of Biological Chemistry

Autores: Pankaj Thapa; Rupesh V. Chikale; Natalia A. Szulc; Maria-Teodora Pandrea; Agnieszka Sztyler; Khushboo Jaggi; Marta Niklewicz; Remigiusz A. Serwa; Thorsten Hoppe; Wojciech Pokrzywa
Publicado en: HSP70 inhibits CHIP E3 ligase activity to maintain germline function in Caenorhabditis elegans., 2024, ISSN 0021-9258
Editor: American Society for Biochemistry and Molecular Biology
DOI: 10.1016/J.JBC.2024.107864

Liver sinusoidal endothelial cells constitute a major route for hemoglobin clearance

Autores: Gabriela Zurawska, Zuzanna Sas, Aneta Jończy, Raghunandan Mahadeva, Patryk Slusarczyk, Marta Chwałek, Daniel Seehofer, Georg Damm, Rafał Mazgaj, Marcin Skórzyński, Maria Kulecka, Izabela Rumieńczyk, Morgane Moulin, Kamil Jastrzębski, Kevin Waldron, Michal Mikula, Anders Etzerodt, Remigiusz Serwa, Marta Miączyńska, Tomasz P Rygiel, Katarzyna Mleczko-Sanecka
Publicado en: EMBO Reports, Edición 27, 2026, ISSN 1469-3178
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S44319-025-00673-5

A single viral enzyme drives tRNA-dependent hypermodification of DNA at adenine

Autores: Rebekah M. B. Silva, Anton Slyvka, Yan-Jiun Lee, Chudi Guan, Sean R. Lund, Elisabeth A. Raleigh, Krzysztof Skowronek, Michael S. Kuska, Matthias Bochtler, Peter R. Weigele
Publicado en: Nature Communications, Edición 17, 2026, ISSN 2041-1723
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-026-70671-1

Ammonia Suppresses the Antitumor Activity of Natural Killer Cells and T Cells by Decreasing Mature Perforin

Autores: Joanna Domagala, Tomasz M. Grzywa, Iwona Baranowska, Magdalena Justyniarska, Ryan Tannir, Agnieszka Graczyk-Jarzynka, Aleksandra Kusowska, Maria Lecka, Marcin Poreba, Klaudyna Fidyt, Katsiaryna Marhelava, Zofia Pilch, Lea K. Picard, Tomasz Wegierski, Kamil Jastrzebski, Marta Krawczyk, Marta Klopotowska, Monika Granica, Doris Urlaub, Szymon Hajduk, Alexandra Neeser, Spencer Moros, Pawel Kozlowski, Malgorzata Bobrowicz, Marta Miaczynska, Leyuan Ma, Carsten Watzl, Magdalena Winiarska
Publicado en: Cancer Research, Edición 85, 2025, ISSN 0008-5472
Editor: American Association for Cancer Research (AACR)
DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-24-0749

Tmbim5 and Slc8b1 cooperate in tissue-specific mitochondrial calcium regulation in zebrafish

Autores: Iga Wasilewska, Łukasz Majewski, Dobrochna Adamek-Urbańska, Sofiia Baranykova, Paulina Castañeda-Tamez, Ilka Wittig, Matylda Macias, Aleksandra Szybińska, Axel Methner
Publicado en: Communications Biology, Edición 9, 2026, ISSN 2399-3642
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42003-025-09494-7

Activity and structure of human (d)CTP deaminase CDADC1

Autores: Anton Slyvka, Ishan Rathore, Renbin Yang, Olga Gewartowska, Tapan Kanai, George T. Lountos, Krzysztof Skowronek, Mariusz Czarnocki-Cieciura, Alexander Wlodawer, Matthias Bochtler
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 122, 2025, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/PNAS.2424245122

Re-adenylation by TENT5A enhances efficacy of SARS-CoV-2 mRNA vaccines

Autores: Paweł S. Krawczyk, Michał Mazur, Wiktoria Orzeł, Olga Gewartowska, Sebastian Jeleń, Wiktor Antczak, Karolina Kasztelan, Aleksandra Brouze, Katarzyna Matylla-Kulińska, Natalia Gumińska, Bartosz Tarkowski, Ewelina P. Owczarek, Kamila Affek, Paweł Turowski, Agnieszka Tudek, Małgorzata Sroka, Tomasz Śpiewla, Monika Kusio-Kobiałka, Aleksandra Wesołowska, Dominika Nowis, Jakub Golab, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity, Andrzej Dziembowski, Seweryn Mroczek
Publicado en: Nature, Edición 641, 2025, ISSN 0028-0836
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41586-025-08842-1

Pulmonary delivery of siRNA lipoplexes and lipid nanoparticles using a vibrating mesh nebuliser

Autores: Michael T. Neary, Lianne M. Mulder, Ciaran O. Leime, Ronan MacLoughlin, Brunella Grassiri, Łukasz Baranowski, Piotr S. Kowalski, Abina M. Crean, Katie B. Ryan
Publicado en: European Journal of Pharmaceutical Sciences, Edición 216, 2026, ISSN 0928-0987
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.EJPS.2025.107386

5′-Triphosphate guanosine RNAs recruit GTP-binding proteins to suppress RIG-I/IFN type I signaling

Autores: Magdalena Wolczyk, Jacek Szymanski, Ivan Trus, Zara Naz, Nathalie Idlin, Michal Lechowski, Emilia Baranowska, Alicja Bis, Jakub Stanislaw Nowak, Tola Tame, Justyna Jackiewicz, Elzbieta Nowak, Christine Wuebben, Gunther Hartmann, Juri Rappsilber, Gracjan Michlewski
Publicado en: Molecular Cell, Edición 86, 2026, ISSN 1097-2765
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MOLCEL.2026.04.014

DIS3L, cytoplasmic exosome catalytic subunit, is essential for development but not cell viability in mice.

Autores: Michał Brouze, Marcin Szpila, Areta Magdalena Czerwińska, Wiktor Antczak, Seweryn Mroczek, Tomasz Kuliński, Anna Maria Hojka-Osińska, Dominik Cysewski, Olga Gewartowska, Dorota Adamska, Jakub Gruchota, Ewa Borsuk, Andrzej Dziembowski
Publicado en: RNA, 2025, ISSN 1355-8382
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1261/RNA.080350.124

Tissue-specific consequences of tag fusions on protein expression in transgenic mice

Autores: Gillian C. A. Taylor, Lewis Macdonald, Natalia A. Szulc, Evelina Gudauskaite, Brianda Hernandez Moran, Jennifer M. Brisbane, Molly Donald, Ella Taylor, Dejin Zheng, Bin Gu, Pleasantine Mill, Patricia L. Yeyati, Wojciech Pokrzywa, Claudia Ribeiro de Almeida, Andrew J. Wood
Publicado en: PLOS Genetics, Edición 21, 2025, ISSN 1553-7404
Editor: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/JOURNAL.PGEN.1011830

Terminal nucleotidyltransferase<i>Tent2</i>microRNA A-tailing enzyme regulates excitatory/inhibitory balance in the hippocampus

Autores: Patrycja Wardaszka-Pianka, Bozena Kuzniewska, Natalia GumiNska, Anna Hojka-Osinska, Monika Puchalska, Jacek Milek, Aleksandra Stawikowska, Pawel Krawczyk, Francois P. Pauzin, Tomasz Wojtowicz, Kasia Radwanska, Clive R. Bramham, Andrzej Dziembowski, Magdalena Dziembowska
Publicado en: RNA, Edición 31, 2025, ISSN 1355-8382
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1261/RNA.080240.124

Polyadenylation landscape of in vivo long-term potentiation in the rat brain

Autores: Natalia Gumińska, Francois P. Pauzin, Bożena Kuźniewska, Jacek Miłek, Patrycja Wardaszka-Pianka, Paweł S. Krawczyk, Seweryn Mroczek, Sebastian Jeleń, Patrick U. Pagenhart, Clive R. Bramham, Andrzej Dziembowski, Magdalena Dziembowska
Publicado en: RNA, Edición 31, 2025, ISSN 1355-8382
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1261/RNA.080485.125

DEGRONOPEDIA: A practical guide to identifying and targeting protein degrons

Autores: Szulc NA, Pokrzywa W.
Publicado en: Methods in Enzymology, ISSN 0076-6879
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/BS.MIE.2025.06.014

The intrinsically disordered AB region: a key modulator of the molecular properties of human RXRγ

Autores: Katarzyna Sołtys, Krzysztof Skowronek, Dominika Bystranowska, Krzysztof Wycisk, Andrzej Ożyhar
Publicado en: Cell Communication and Signaling, Edición 23, 2025, ISSN 1478-811X
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S12964-025-02247-3

Cryo-EM Structure of raiA ncRNA From Clostridium Reveals a New RNA 3D Fold

Autores: Nagendar Goud Badepally, Tales Rocha de Moura, Elżbieta Purta, Eugene F. Baulin, Janusz M. Bujnicki
Publicado en: Journal of Molecular Biology, Edición 436, 2025, ISSN 0022-2836
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JMB.2024.168833

DIS3L, cytoplasmic exosome catalytic subunit, is essential for development but not cell viability in mice.

Autores: Michał Brouze, Marcin Szpila, Areta Magdalena Czerwińska, Wiktor Antczak, Seweryn Mroczek, Tomasz Kuliński, Anna Maria Hojka-Osińska, Dominik Cysewski, Olga Gewartowska, Dorota Adamska, Jakub Gruchota, Ewa Borsuk, Andrzej Dziembowski
Publicado en: RNA, 2025, ISSN 1355-8382
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1261/RNA.080350.124

DIS3 mutations enhance AID-driven translocations during B-cell activation, promoting transformation to multiple myeloma

Autores: Tomasz M. Kuliński, Olga Gewartowska, Mélanie Mahé, Karolina Kasztelan, Nina Durys, Anna Stroynowska-Czerwińska, Marta Jedynak-Slyvka, Ewelina P. Owczarek, Debadeep Chaudhury, Marcin Nowotny, Aleksandra Pękowska, Bertrand Séraphin, Andrzej Dziembowski
Publicado en: Nature Communications, Edición 17, 2026, ISSN 2041-1723
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-026-70386-3

BMC Biology

Autores: Nathalie Idlin; Sivakumar Krishnamoorthy; Magdalena Wolczyk; Mouad Fakhri; Michal Lechowski; Natalia Stec; Jacek Milek; Pratik Kumar Mandal; Jaroslaw Cendrowski; Christos Spanos; Magdalena Dziembowska; Katarzyna Mleczko-Sanecka; Juri Rappsilber; Gracjan Michlewski
Publicado en: BMC Biology, 2025, ISSN 1741-7007
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1186/S12915-025-02131-Z

The expanding repertoire of ESCRT functions in cell biology and disease

Autores: James H. Hurley, Alyssa N. Coyne, Marta Miączyńska, Harald Stenmark
Publicado en: Nature, Edición 642, 2026, ISSN 0028-0836
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41586-025-08950-Y

5′ terminal nucleotide determines the immunogenicity of IVT RNAs

Autores: Magdalena Wolczyk; Jacek Szymanski; Ivan Trus; Zara Naz; Tola Tame; Agnieszka Bolembach; Nila Roy Choudhury; Karolina Kasztelan; Juri Rappsilber; Andrzej Dziembowski; Gracjan Michlewski
Publicado en: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAE1252

TENT-5 polyadenylates and regulates male-specific transcripts in <i>Caenorhabditis elegans</i>

Autores: Zuzanna Mackiewicz, Vladyslava Liudkovska, Andrzej Dziembowski
Publicado en: G3: Genes, Genomes, Genetics, Edición 16, 2026, ISSN 2160-1836
Editor: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/G3JOURNAL/JKAG058

Mutation in the mitochondrial chaperone TRAP1 leads to autism with more severe symptoms in males

Autores: Małgorzata Rydzanicz, Bozena Kuzniewska, Marta Magnowska, Tomasz Wójtowicz, Aleksandra Stawikowska, Anna Hojka, Ewa Borsuk, Ksenia Meyza, Olga Gewartowska, Jakub Gruchota, Jacek Miłek, Patrycja Wardaszka, Izabela Chojnicka, Ludwika Kondrakiewicz, Dorota Dymkowska, Alicja Puścian, Ewelina Knapska, Andrzej Dziembowski, Rafał Płoski, Magdalena Dziembowska
Publicado en: EMBO Molecular Medicine, Edición 16, 2024, ISSN 1757-4684
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S44321-024-00147-6

MODOMICS: a database of RNA modifications and related information. 2025 update and 20th anniversary

Autores: Dominik Sordyl, Etienne Boileau, Agata Bernat, Satyabrata Maiti, Sunandan Mukherjee, S Naeim Moafinejad, Masoud Amiri Farsani, Anastasiya Shavina, Andrea Cappannini, Giada Agostini, Silvestro G Conticello, Filip Stefaniak, Christoph Dieterich, Elżbieta Purta, Janusz M Bujnicki
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 54, 2026, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAF1284

Direct profiling of non-adenosines in poly(A) tails of endogenous and therapeutic mRNAs with Ninetails

Autores: Natalia Gumińska, Katarzyna Matylla-Kulińska, Paweł S. Krawczyk, Michał Maj, Wiktoria Orzeł, Zuzanna Mackiewicz, Aleksandra Brouze, Seweryn Mroczek, Andrzej Dziembowski
Publicado en: Nature Communications, Edición 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-57787-6

Degron models: a toolbox for rapid in vivo depletion of essential proteins regulating mRNA metabolism

Autores: Wiktor Antczak, Marcin Szpila, Katarzyna Sałas, Patrycja Daszczuk, Vanessa Linke, Marta Miączyńska, Andrzej Dziembowski, Olga Gewartowska
Publicado en: Communications Biology, Edición 9, 2026, ISSN 2399-3642
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42003-026-09828-Z

Excretory gland cell and NSPC genes in <i>C. elegans</i>: investigating their physiological roles

Autores: Zuzanna Mackiewicz, Vladyslava Liudkovska, Andrzej Dziembowski
Publicado en: GENETICS, Edición 231, 2025, ISSN 1943-2631
Editor: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/GENETICS/IYAF125

Trifluoperazine, an Antipsychotic Drug, Inhibits Viability of Cells Derived From <scp>SEGA</scp> and Cortical Tubers Cultured In Vitro

Autores: Malgorzata Urbanska, Krzysztof Sadowski, Aleksandra Stawikowska, Ewa Liszewska, Magdalena Mlostek, Wieslawa Grajkowska, Katarzyna Kotulska
Publicado en: Journal of Neurochemistry, Edición 169, 2026, ISSN 0022-3042
Editor: Wiley
DOI: 10.1111/JNC.70247

Modeling of mRNA deadenylation rates reveal a complex relationship between mRNA deadenylation and decay

Autores: Agnieszka Czarnocka-Cieciura, Jarosław Poznański, Matti Turtola, Rafał Tomecki, Paweł S Krawczyk, Seweryn Mroczek, Wiktoria Orzeł, Upasana Saha, Torben Heick Jensen, Andrzej Dziembowski, Agnieszka Tudek
Publicado en: The EMBO Journal, Edición 43, 2024, ISSN 1460-2075
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S44318-024-00258-3

Structural snapshots of the mechanism of ATP-dependent DNA damage recognition by UvrA

Autores: Shivlee Nirwal, Mariusz Czarnocki-Cieciura, Weronika Zajko, Krzysztof Skowronek, Roman H. Szczepanowski, Marcin Nowotny
Publicado en: Nature Communications, Edición 17, 2026, ISSN 2041-1723
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-67075-Y

Protocol for the preparation of zebrafish whole heart cell suspension for single-cell analyses

Autores: Karim Abu Nahia; Cecilia Lanny Winata
Publicado en: STAR Protocols, 2025, ISSN 2666-1667
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/J.XPRO.2024.103586

From discovery to potential application: engineering a novel M23 peptidase to combat Listeria monocytogenes

Autores: Magdalena Kaus-Drobek, Marzena Nowacka, Magdalena Gewartowska, Małgorzata Korzeniowska nee Wiweger, Merete Rusås Jensen, Trond Møretrø, Even Heir, Elżbieta Nowak, Izabela Sabała
Publicado en: Scientific Reports, Edición 15, 2025, ISSN 2045-2322
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41598-025-99141-2

Methods in Enzymology

Autores: Piechota M, Pokrzywa W.
Publicado en: Methods in Enzymology, ISSN 0076-6879
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/BS.MIE.2025.06.026

ARTEM server: an online tool for nucleic acid 3D motif searches, 3D structure superposition and structure-based alignment

Autores: Dominik Sordyl, Jan Cielesz, Davyd R Bohdan, Eugene F Baulin, Janusz M Bujnicki
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 54, 2026, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAG428

Derechos de propiedad intelectual

Patent (3)

Derivative of monophosphate dinucleotide, nucleic acid derivative containing it, and a method of obtaining it

Número de solicitud/publicación: 44 603623
Fecha: 2023-09-06
Solicitante(s): MIEDZYNARODOWY INSTYTUT BIOLOGII MOLEKULARNEJ I KOMORKOWEJ W WARSZAWIE

EEN EIWIT DAT SPECIFIEK BINDT AAN RNA/DNA-HYBRIDEN

Número de solicitud/publicación: 20 2405324
Fecha: 2024-06-05
Solicitante(s): MIEDZYNARODOWY INSTYTUT BIOLOGII MOLEKULARNEJ I KOMORKOWEJ W WARSZAWIE

RNA MOLECULES WITH MODIFIED 3' TERMINAL SEQUENCES AND APPLICATION THEREOF

Número de solicitud/publicación: 20 24050093
Fecha: 2024-11-22
Solicitante(s): MIEDZYNARODOWY INSTYTUT BIOLOGII MOLEKULARNEJ I KOMORKOWEJ W WARSZAWIE