Descripción del proyecto
Los cardioides rastrean los latidos del corazón
Durante el desarrollo inicial del corazón, una compleja e intrincada red de factores de transcripción controla el desarrollo de un tubo cardíaco que late mediante la activación de elementos reguladores, denominados «estimuladores cardíacos», que integran las señales de los tejidos circundantes. La forma en que se controla este proceso sigue siendo un misterio y aún no está claro cómo las mutaciones en los estimuladores cardíacos dan lugar a las miocardiopatías. El equipo del proyecto Cardioide 3-D, financiado con fondos europeos, utilizará cardioides y organoides cardíacos de última generación derivados de células madre pluripotentes inducidas humanas. Por primera vez en estos modelos «in vitro», se aplicarán enfoques genómicos de célula única en diferentes etapas para rastrear el desarrollo del corazón humano y la regulación de los genes durante la cardiogénesis.
Objetivo
The early steps of heart formation during embryogenesis require precise spatiotemporal coordination between different heart progenitors to join together to form a beating heart tube. This complex biological process is regulated through an evolutionary conserved gene regulatory network (GRN) of transcription factors and cis-regulatory elements that integrate inductive signals from surrounding tissues to ensure correct heart development. Yet, how this process is controlled during heart development, and how mutations impacting the cardiac GRN leads to cardiomyopathies, remains unclear. There is currently little or no information about human heart enhancers during these early stages of heart development. Here, we will first determine the dynamic changes in the usage of regulatory elements and gene expression that accompanies human heart development using heart organoids (cardioids) derived from human induced pluripotent stem cells. To uncover the underlying GRN, we will apply scRNA-seq and scATAC-seq to 3-D cardioids at different stages of development, which will allow us to map enhancer usage during cell fate transitions in human heart development for the first time in vitro. Moreover, we will study how developmental trajectories are altered in disease-relevant mutant 3-D cardioids models. Last, we will study how perturbations of transcription factors influence enhancer function and gene expression by fine-tuning the nuclear level of key regulators using an optogenetic tool developed by the Furlong lab, which is extremely dynamic providing very precise temporal resolution, in the order of minutes. The functional impact of these perturbations will be assessed by scRNA-seq and scATAC-seq to identify the transcription factors regulatory mechanisms. Together, these findings will advance our understanding of gene regulation during cardiogenesis by identifying fundamental principles of enhancer usage and transcriptional changes during normal and diseased heart development.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas biología del desarrollo
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2021-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
69117 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.