Descrizione del progetto
In un battito… cardiaco, tracciato dai cardioidi
Nella morfogenesi cardiaca, una complessa e intricata rete di fattori di trascrizione controlla lo sviluppo del tubo cardiaco pulsante mediante l’attivazione di elementi regolatori, chiamati potenziatori cardiaci, che integrano i segnali provenienti dai tessuti circostanti. Le modalità attraverso cui questo processo viene controllato sono tuttora un mistero e il modo in cui le mutazioni nei potenziatori cardiaci determinano l’insorgenza delle cardiomiopatie è tuttora poco chiaro. Il progetto 3-D Cardioid, finanziato dall’UE, si avvarrà di cardioidi e organoidi cardiaci all’avanguardia derivati da cellule staminali pluripotenti indotte umane. Per la prima volta con questi modelli in vitro, verranno applicati approcci genomici a singola cellula in diverse fasi allo scopo di mappare lo sviluppo del cuore umano e la regolazione genica nel corso della cardiogenesi.
Obiettivo
The early steps of heart formation during embryogenesis require precise spatiotemporal coordination between different heart progenitors to join together to form a beating heart tube. This complex biological process is regulated through an evolutionary conserved gene regulatory network (GRN) of transcription factors and cis-regulatory elements that integrate inductive signals from surrounding tissues to ensure correct heart development. Yet, how this process is controlled during heart development, and how mutations impacting the cardiac GRN leads to cardiomyopathies, remains unclear. There is currently little or no information about human heart enhancers during these early stages of heart development. Here, we will first determine the dynamic changes in the usage of regulatory elements and gene expression that accompanies human heart development using heart organoids (cardioids) derived from human induced pluripotent stem cells. To uncover the underlying GRN, we will apply scRNA-seq and scATAC-seq to 3-D cardioids at different stages of development, which will allow us to map enhancer usage during cell fate transitions in human heart development for the first time in vitro. Moreover, we will study how developmental trajectories are altered in disease-relevant mutant 3-D cardioids models. Last, we will study how perturbations of transcription factors influence enhancer function and gene expression by fine-tuning the nuclear level of key regulators using an optogenetic tool developed by the Furlong lab, which is extremely dynamic providing very precise temporal resolution, in the order of minutes. The functional impact of these perturbations will be assessed by scRNA-seq and scATAC-seq to identify the transcription factors regulatory mechanisms. Together, these findings will advance our understanding of gene regulation during cardiogenesis by identifying fundamental principles of enhancer usage and transcriptional changes during normal and diseased heart development.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biologia dello sviluppo
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2021-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
69117 Heidelberg
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.