Nonequilibrium thermodynamics of the origin of life

Informations projet

NETOLife

N° de convention de subvention: 101068029

DOI

10.3030/101068029

Projet clôturé

Date de signature de la CE 15 Juin 2022

Date de début 1 Juin 2023

Date de fin 31 Juillet 2026

Financé au titre de

• Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)

Coût total

Aucune donnée

Contribution de l’UE

€ 181 152,96

Coordonné par

UNIVERSIDAD POMPEU FABRA
Spain

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

The Data Management Plan describes the data management life cyclefor all data sets that will be collected, processed or generated by the action. It is adocument describing what data will be collected, processed or generated andfollowing what methodology and standards, whether and how this data will beshared and/or made open, and how it will be curated and preserved.

Documents, reports (1)

Communication, Dissemination & Outreach Plan

The plan describes the planned measures to maximize the impact ofthe project, including the dissemination and exploitation measures that are planned,and the target group(s) addressed. Regarding communication measures and publicengagement strategy, the aim is to inform and reach out to society and show theactivities performed, and the use and the benefits the project will have for citizens.

Publications

Peer reviewed articles (20)

Information bounds production in replicator systems

Auteurs: Jordi Piñero, Damian R. Sowinski, Gourab Ghoshal, Adam Frank, Artemy Kolchinsky
Publié dans: Communications Physics, Numéro 9, 2026, ISSN 2399-3650
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42005-026-02527-5

Maximizing Free Energy Gain

Auteurs: Artemy Kolchinsky, Iman Marvian, Can Gokler, Zi-Wen Liu, Peter Shor, Oles Shtanko, Kevin Thompson, David Wolpert, Seth Lloyd
Publié dans: Entropy, Numéro 27, 2025, ISSN 1099-4300
Éditeur: MDPI AG
DOI: 10.3390/E27010091

Inferring Entropy Production in Many-Body Systems Using Nonequilibrium Maximum Entropy

Auteurs: Miguel Aguilera, Sosuke Ito, Artemy Kolchinsky
Publié dans: Physical Review Letters, Numéro 136, 2026, ISSN 0031-9007
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/XGKJ-DXZH

Protocellular energy transduction, information and fitness

Auteurs: Kristoffer Reinholt Thomsen, Artemy Kolchinsky, Steen Rasmussen
Publié dans: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numéro 380, 2026, ISSN 0962-8436
Éditeur: The Royal Society
DOI: 10.1098/RSTB.2024.0294

Elementary derivation of the dissipation-coherence bound for stochastic oscillators

Auteurs: Artemy Kolchinsky
Publié dans: Physical Review E, Numéro 114, 2026, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/YJ2T-FRGZ

Optimization of nonequilibrium free energy harvesting illustrated on bacteriorhodopsin

Auteurs: Jordi Piñero, Ricard Solé, Artemy Kolchinsky
Publié dans: Physical Review Research, Numéro 6, 2024, ISSN 2643-1564
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/PHYSREVRESEARCH.6.013275

Optimization of nonequilibrium free energy harvesting illustrated on bacteriorhodopsin

Auteurs: Jordi Piñero; Ricard Solé; Artemy Kolchinsky
Publié dans: Physical Review Research, 2024, ISSN 2643-1564
Éditeur: APS
DOI: 10.1103/PHYSREVRESEARCH.6.013275

Thermodynamic bound on spectral perturbations, with applications to oscillations and relaxation dynamics

Auteurs: Artemy Kolchinsky, Naruo Ohga, Sosuke Ito
Publié dans: Physical Review Research, Numéro 6, 2024, ISSN 2643-1564
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/PHYSREVRESEARCH.6.013082

Thermodynamic Geometric Constraint on the Spectrum of Markov Rate Matrices

Auteurs: Guo-Hua Xu, Artemy Kolchinsky, Jean-Charles Delvenne, Sosuke Ito
Publié dans: Physical Review Letters, Numéro 135, 2025, ISSN 0031-9007
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/Z4T2-18CX

What it takes to solve the origins of life: An integrated review. Part 2: Theoretical methods and emerging trends

Auteurs: Silke Asche, Carla Bautista, Celia Blanco, David Boulesteix, Alexandre Champagne-Ruel, Cole Mathis, Omer Markovitch, Zhen Peng, Avinash Vicholous Dass, Alyssa Adams, Eloi Camprubi, Enrico Sandro Colizzi, Stephanie Colón-Santos, Hannah Dromiack, Valentina Erastova, Amanda Garcia, Ghjuvan Grimaud, Aaron Halpern, Stuart A. Harrison, Seán F. Jordan, Tony Z. Jia, Amit Kahana, Artemy Kolchinsky, Odin Moron-Garcia, Ryo Mizuuchi, Jingbo Nan, Yuliia Orlova, Ben K.D. Pearce, Klaus Paschek, Martina Preiner, Silvana Pinna, Eduardo Rodríguez-Román, Loraine Schwander, Siddhant Sharma, Harrison B. Smith, Andrey Vieira, Joana C. Xavier
Publié dans: Cell Reports Physical Science, Numéro 7, 2026, ISSN 2666-3864
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.XCRP.2026.103211

Thermodynamics of Darwinian selection in molecular replicators

Auteurs: Artemy Kolchinsky
Publié dans: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numéro 380, 2026, ISSN 0962-8436
Éditeur: The Royal Society
DOI: 10.1098/RSTB.2024.0436

Neutral theory of cooperative dynamics

Auteurs: Jordi Piñero, Artemy Kolchinsky, Sidney Redner, Ricard Solé
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 122, 2025, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/PNAS.2515423122

Fundamental constraints to the logic of living systems

Auteurs: Ricard Solé, Christopher P. Kempes, Bernat Corominas-Murtra, Manlio De Domenico, Artemy Kolchinsky, Michael Lachmann, Eric Libby, Serguei Saavedra, Eric Smith, David Wolpert
Publié dans: Interface Focus, Numéro 14, 2024, ISSN 2042-8898
Éditeur: The Royal Society
DOI: 10.1098/RSFS.2024.0010

Partial Information Decomposition: Redundancy as Information Bottleneck

Auteurs: Artemy Kolchinsky
Publié dans: Entropy, Numéro 26, 2025, ISSN 1099-4300
Éditeur: MDPI AG
DOI: 10.3390/E26070546

Physics of Life: Exploring Information as a Distinctive Feature of Living Systems

Auteurs: Stuart Bartlett, Andrew W. Eckford, Matthew Egbert, Manasvi Lingam, Artemy Kolchinsky, Adam Frank, Gourab Ghoshal
Publié dans: PRX Life, Numéro 3, 2025, ISSN 2835-8279
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/RSX4-8X5F

Generalized free energy and excess/housekeeping decomposition in nonequilibrium systems: From large deviations to thermodynamic speed limits

Auteurs: Artemy Kolchinsky, Andreas Dechant, Kohei Yoshimura, Sosuke Ito
Publié dans: Physical Review Research, Numéro 8, 2026, ISSN 2643-1564
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/R48T-DGHL

What it takes to solve the origin of life: An integrated review. Part 1–Experimental methods and data repositories

Auteurs: Silke Asche, Carla Bautista, Celia Blanco, David Boulesteix, Alexandre Champagne-Ruel, Cole Mathis, Omer Markovitch, Zhen Peng, Avinash Vicholous Dass, Alyssa Adams, Eloi Camprubi, Enrico Sandro Colizzi, Stephanie Colón-Santos, Hannah Dromiack, Valentina Erastova, Amanda Garcia, Ghjuvan Grimaud, Aaron Halpern, Stuart A. Harrison, Seán F. Jordan, Tony Z. Jia, Amit Kahana, Artemy Kolchinsky, Odin Moron-Garcia, Ryo Mizuuchi, Jingbo Nan, Yuliia Orlova, Ben K.D. Pearce, Klaus Paschek, Martina Preiner, Silvana Pinna, Eduardo Rodríguez-Román, Loraine Schwander, Siddhant Sharma, Harrison B. Smith, Andrey Vieira, Joana C. Xavier
Publié dans: Cell Reports Physical Science, Numéro 7, 2026, ISSN 2666-3864
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.XCRP.2026.103212

Thermodynamic dissipation does not bound replicator growth and decay rates

Auteurs: Artemy Kolchinsky
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, Numéro 161, 2024, ISSN 0021-9606
Éditeur: AIP Publishing
DOI: 10.1063/5.0213466

Geometric thermodynamics of reaction-diffusion systems: Thermodynamic trade-off relations and optimal transport for pattern formation

Auteurs: Ryuna Nagayama, Kohei Yoshimura, Artemy Kolchinsky, Sosuke Ito
Publié dans: Physical Review Research, Numéro 7, 2025, ISSN 2643-1564
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/PHYSREVRESEARCH.7.033011

Spatiotemporal Organization of Chemical Oscillators via Phase Separation

Auteurs: Jonathan Bauermann, Giacomo Bartolucci, Artemy Kolchinsky
Publié dans: Physical Review Letters, Numéro 136, 2026, ISSN 0031-9007
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/SHZ6-7FJ9