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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Single molecule reconstruction for high-throughput, short-read sequencing technologies

Objectif

Current advanced short-read sequencing technologies and third generation long-read sequencing technologies are still not capable of full molecule reconstruction in a high throughput manner due to their limited read length and throughput respectively.
This project aims at bridging the gap between long reads and high throughput by developing a fragment labelling system compatible to high-throughput short-read Illumina sequencing technology. The labelling system consist of tags that can be incorporated into the target nucleic acid sequences using Tn5-transposase and can be subsequently used to create fragments from the target molecule, allowing the generated fragments to retain information of their original position in the target molecule, thus the reconstruction of the sequence of the original, individual target molecules from them.
This technology has considerable market potential due to its relatively high ease of market entry as it can be incorporated in existing library preparation techniques for next generation sequencing since many of them readily use Tn5 transposase for fragment generation. Additionally, the ability to be able to link the short, high accuracy reads generated by high throughput next generation sequencing technologies can have a large interest in the field of genomics, by allowing the complete reconstruction of diploid human genomes by tackling more difficult, highly repetitive genomic segments, in the field metagenomics, by enabling the assembly of more complete genomes from clinical samples, and also in the field of transcriptomics, by providing information about isoform- and allelic-specific expression through the reconstruction of full length transcripts.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-POC1

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

KAROLINSKA INSTITUTET
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 120 000,00
Adresse
NOBELS VAG 5
171 77 STOCKHOLM
Suède

Voir sur la carte

Région
Östra Sverige Stockholm Stockholms län
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Bénéficiaires (2)

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